ในช่วงปลายศตวรรษที่ 11 ราชวงศ์ควาราซเมียนเข้าควบคุมอิรักช่วงเวลานี้ของการปกครองฆราวาสเตอร์กและหัวหน้าศาสนาอิสลามอับบาซิดสิ้นสุดลงด้วยการรุกรานมองโกลในศตวรรษที่ 13ชาว ^{[มองโกล]} ซึ่งนำโดยเจงกีสข่านได้ยึดครองควาเรซเมียได้ภายในปี 1221 อย่างไรก็ตาม อิรักได้รับการบรรเทาโทษชั่วคราวเนื่องจากการสวรรคตของเจงกีสข่านในปี 1227 และการแย่งชิงอำนาจในเวลาต่อมาภายในจักรวรรดิมองโกลMöngke Khan ตั้งแต่ปี 1251 ได้จุดประกายการขยายตัวของชาวมองโกล และเมื่อกาหลิบอัล-มุสตาซิมปฏิเสธข้อเรียกร้องของชาวมองโกล แบกแดดต้องเผชิญกับการปิดล้อมที่นำโดยฮูลากู ข่านในปี 1258การปิดล้อมแบกแดดซึ่งเป็นเหตุการณ์สำคัญในการพิชิตมองโกล กินเวลา 13 วันตั้งแต่วันที่ 29 มกราคม ถึง 10 กุมภาพันธ์ ค.ศ. 1258 กอง กำลังมองโกลอิลคานา เตะพร้อมด้วยพันธมิตร ได้ปิดล้อม ถูกจับกุม และท้ายที่สุดก็ไล่แบกแดดซึ่งเป็นเมืองหลวงของหัวหน้าศาสนาอิสลามอับบาซิดในขณะนั้นออก .การล้อมครั้งนี้ส่งผลให้มีการสังหารหมู่ชาวเมืองส่วนใหญ่ ซึ่งอาจมีจำนวนนับแสนคนขอบเขตของการทำลายห้องสมุดของเมืองและเนื้อหาอันมีค่าของห้องสมุดยังคงเป็นหัวข้อถกเถียงในหมู่นักประวัติศาสตร์กองกำลังมองโกลประหารชีวิตอัล-มุสตาซิม และทำให้จำนวนประชากรลดลงและการทำลายล้างอย่างรุนแรงในกรุงแบกแดดการปิดล้อมครั้งนี้ถือเป็นการสิ้นสุดยุคทองของอิสลามในเชิงสัญลักษณ์ ซึ่งเป็นช่วงเวลาที่คอลีฟะห์ได้ขยายอำนาจจากคาบสมุทรไอบีเรียไปยังแคว้นซินด์ห์