กัมพูชาถูกโจมตีโดย อาณาจักรอยุธยา ซึ่งนำโดยเจ้าชายไทยและขุนศึกนเรศวรในปี พ.ศ. 2126 สงครามเริ่มขึ้นในปี พ.ศ. ^[2134] เมื่อพระนครศรีอยุธยาบุกกัมพูชาเพื่อตอบโต้การรุกรานของเขมรอย่างต่อเนื่องในดินแดนของตนราชอาณาจักรกัมพูชาก็เผชิญกับความขัดแย้งทางศาสนาภายในประเทศเช่นกันนี่ทำให้สยามมีโอกาสที่ดีเยี่ยมในการรุกรานลองเวคถูกจับในปี พ.ศ. 2137 ซึ่งเป็นจุดเริ่มต้นของการสถาปนาผู้ว่าราชการทหารสยามในเมืองนับเป็นครั้งแรกที่มีการสถาปนาระดับการควบคุมทางการเมืองจากต่างประเทศเหนือราชอาณาจักร เมื่อที่นั่งของกษัตริย์ถูกลดระดับลงเหลือเพียงข้าราชบริพารภายหลังสยามยึดเมืองหลวงที่ลองเวก ราชวงศ์กัมพูชาก็ถูกจับเป็นตัวประกัน ^[และ] ย้ายไปอยู่ที่ราชสำนักกรุงศรีอยุธยา โดยอยู่ภายใต้อิทธิพลของไทยอย่างถาวร และปล่อยให้มีการประนีประนอมและแข่งขันกันเองภายใต้การพิจารณาของเจ้าเหนือหัว^[61]