ในวันที่ 21 ตุลาคม พ.ศ. 2397 เธอและเจ้าหน้าที่พยาบาลอาสาสมัครหญิง 38 คน รวมทั้งหัวหน้าพยาบาลของเธอ เอลิซา โรเบิร์ตส์ และป้าของเธอ ไม สมิธ และแม่ชีคาทอลิก 15 คนถูกส่งไปยัง จักรวรรดิออตโตมันไนติงเกลมาถึงค่ายทหาร Selimiye ใน Scutari ในช่วงต้นเดือนพฤศจิกายน พ.ศ. 2397 ทีมงานของเธอพบว่าการดูแลทหารที่ได้รับบาดเจ็บที่ไม่ดีนั้นดำเนินการโดยเจ้าหน้าที่ทางการแพทย์ที่ทำงานหนักเกินไปเมื่อเผชิญกับความเฉยเมยของเจ้าหน้าที่ยาขาดแคลน สุขอนามัยถูกละเลย และการติดเชื้อในวงกว้างเป็นเรื่องปกติ หลายคนถึงแก่ชีวิตไม่มีอุปกรณ์ในการแปรรูปอาหารให้ผู้ป่วยหลังจากที่ไนติงเกลส่งคำร้องขอให้รัฐบาลแก้ไขสภาพที่ย่ำแย่ของสถานที่เหล่านั้น รัฐบาลอังกฤษได้มอบหมายให้ Isambard Kingdom Brunel ออกแบบโรงพยาบาลสำเร็จรูปที่สามารถสร้างในอังกฤษและส่งไปยังดาร์ดาแนลส์ได้ผลลัพธ์ที่ได้คือโรงพยาบาล Renkioi ซึ่งเป็นสถานพยาบาลพลเรือนที่ภายใต้การบริหารของ Edmund Alexander Parkes มีอัตราการเสียชีวิตน้อยกว่าหนึ่งในสิบของอัตราการเสียชีวิตของ Scutariสตีเฟน พาเก็ทในพจนานุกรมชีวประวัติแห่งชาติ ยืนยันว่าไนติงเกลลดอัตราการเสียชีวิตจาก 42% เหลือ 2% ไม่ว่าจะโดยการปรับปรุงสุขอนามัยด้วยตนเอง หรือโดยการเรียกร้องให้คณะกรรมการสุขาภิบาลตัวอย่างเช่น นกไนติงเกลใช้วิธีล้างมือและสุขอนามัยอื่นๆ ในโรงพยาบาลสงครามที่เธอทำงานอยู่