1958 ஆம் ஆண்டில், பாகிஸ்தானின் நாடாளுமன்ற அமைப்பு இராணுவச் சட்டம் திணிக்கப்பட்டதன் மூலம் முடிவுக்கு வந்தது.சிவில் அதிகாரத்துவம் மற்றும் நிர்வாகத்தில் ஊழலால் பொதுமக்கள் ஏமாற்றமடைந்ததால், ஜெனரல் அயூப் கானின் நடவடிக்கைகளுக்கு ஆதரவு கிடைத்தது.^[16] இராணுவ அரசாங்கம் குறிப்பிடத்தக்க நிலச் சீர்திருத்தங்களை மேற்கொண்டது மற்றும் எச்.எஸ்.சுஹ்ரவர்தியை பொது அலுவலகத்திலிருந்து தடைசெய்து, தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட உடல்கள் தகுதிநீக்க ஆணையை அமல்படுத்தியது.கான் "அடிப்படை ஜனநாயகம்" என்ற புதிய ஜனாதிபதி முறையை அறிமுகப்படுத்தினார், அங்கு 80,000 பேர் கொண்ட தேர்தல் கல்லூரி ஜனாதிபதியைத் தேர்ந்தெடுத்து 1962 அரசியலமைப்பை வெளியிட்டது.^[17] 1960 இல், அயூப் கான் ஒரு தேசிய வாக்கெடுப்பில் மக்கள் ஆதரவைப் பெற்றார், இராணுவத்திலிருந்து அரசியலமைப்பு சிவில் அரசாங்கமாக மாறினார்.^[16]அயூப் கான் ஜனாதிபதியாக இருந்தபோது குறிப்பிடத்தக்க முன்னேற்றங்கள் கராச்சியிலிருந்து இஸ்லாமாபாத்திற்கு தலைநகரின் உள்கட்டமைப்பை மாற்றியது."பெரிய தசாப்தம்" என்று அழைக்கப்படும் இந்த சகாப்தம், அதன் பொருளாதார வளர்ச்சி மற்றும் கலாச்சார மாற்றங்களுக்காக கொண்டாடப்படுகிறது, ^[18] பாப் இசை, திரைப்படம் மற்றும் நாடகத் தொழில்களின் எழுச்சி உட்பட.அயூப் கான் பாகிஸ்தானை அமெரிக்கா மற்றும் மேற்கத்திய உலகத்துடன் இணைத்து, மத்திய ஒப்பந்த அமைப்பு (சென்டோ) மற்றும் தென்கிழக்கு ஆசிய ஒப்பந்த அமைப்பு (சீட்டோ) ஆகியவற்றில் இணைந்தார்.தனியார் துறை வளர்ந்தது, மேலும் நாடு கல்வி, மனித மேம்பாடு மற்றும் அறிவியலில் முன்னேற்றம் கண்டது, இதில் விண்வெளித் திட்டத்தைத் தொடங்குவது மற்றும் அணுசக்தித் திட்டத்தைத் தொடர்வது உட்பட.^[18]இருப்பினும், 1960 இல் U2 உளவு விமான சம்பவம் பாகிஸ்தானில் இருந்து அமெரிக்க இரகசிய நடவடிக்கைகளை அம்பலப்படுத்தியது, தேசிய பாதுகாப்பை சமரசம் செய்தது.அதே ஆண்டில், உறவுகளை சீராக்க இந்தியாவுடன் சிந்து நதி நீர் ஒப்பந்தத்தில் பாகிஸ்தான் கையெழுத்திட்டது.^[19] சீனாவுடனான உறவுகள் வலுப்பெற்றன, குறிப்பாக சீன-இந்தியப் போருக்குப் பிறகு, 1963 இல் ஒரு எல்லை ஒப்பந்தத்திற்கு வழிவகுத்தது, இது பனிப்போர் இயக்கவியலை மாற்றியது.1964 இல், பாக்கிஸ்தானிய ஆயுதப் படைகள் மேற்கு பாகிஸ்தானில் சந்தேகத்திற்குரிய கம்யூனிஸ்ட் சார்பு கிளர்ச்சியை அடக்கியது, மேலும் 1965 இல், பாத்திமா ஜின்னாவுக்கு எதிராக சர்ச்சைக்குரிய ஜனாதிபதித் தேர்தலில் அயூப் கான் குறுகிய வெற்றியைப் பெற்றார்.