ஒட்டோமான் போர்ட்டை ஆதரிப்பதற்கும்மம்லூக்குகளை அடக்குவதற்கும் எகிப்துக்கு பிரெஞ்சுப் பயணம் நெப்போலியன் போனபார்டே தலைமையில் இருந்தது.அலெக்ஸாண்ட்ரியாவில் போனபார்ட்டின் பிரகடனம் சமத்துவம், தகுதி மற்றும் இஸ்லாத்திற்கான மரியாதை ஆகியவற்றை வலியுறுத்தியது, மம்லூக்குகள் இந்த குணங்கள் இல்லை என்று கூறப்படுவதற்கு மாறாக.நிர்வாக பதவிகளுக்கு அனைத்து எகிப்தியர்களுக்கும் திறந்த அணுகலை அவர் உறுதியளித்தார் மற்றும் இஸ்லாத்தை பிரெஞ்சு பின்பற்றுவதை நிரூபிக்க போப்பாண்டவர் அதிகாரத்தை தூக்கியெறிய பரிந்துரைத்தார்.^[102]இருப்பினும், எகிப்தியர்கள் பிரெஞ்சு நோக்கங்களில் சந்தேகம் கொண்டிருந்தனர்.முராத் பே மற்றும் இப்ராஹிம் பேயின் படைகள் தோற்கடிக்கப்பட்ட எம்பாபே போரில் (பிரமிடுகளின் போர்) பிரெஞ்சு வெற்றிக்குப் பிறகு, கெய்ரோவில் ஷேக்குகள், மம்லுக்ஸ் மற்றும் பிரெஞ்சு உறுப்பினர்கள் உட்பட ஒரு நகராட்சி கவுன்சில் உருவாக்கப்பட்டது, முக்கியமாக பிரெஞ்சு ஆணைகளை அமல்படுத்துவதற்கு சேவை செய்தது.^[102]நைல் போரில் அவர்களின் கடற்படையின் தோல்வி மற்றும் மேல் எகிப்தில் தோல்விக்குப் பிறகு பிரெஞ்சு வெல்ல முடியாத தன்மை கேள்விக்குள்ளானது.அக்டோபர் 1798 இல் கெய்ரோவில் ஒரு கிளர்ச்சிக்கு வழிவகுத்தது, வீட்டு வரி அறிமுகப்படுத்தப்பட்டதன் மூலம் பதட்டங்கள் அதிகரித்தன. பிரெஞ்சு ஜெனரல் டுபுய் கொல்லப்பட்டார், ஆனால் போனபார்டே மற்றும் ஜெனரல் க்ளெபர் விரைவில் எழுச்சியை அடக்கினர்.அல்-அஸ்ஹர் மசூதியை பிரெஞ்சு தொழுவமாகப் பயன்படுத்தியது ஆழ்ந்த குற்றத்தை ஏற்படுத்தியது.^[102]1799 இல் போனபார்ட்டின் சிரியப் பயணம் எகிப்தில் பிரெஞ்சு கட்டுப்பாட்டை தற்காலிகமாக பலவீனப்படுத்தியது.அவர் திரும்பியதும், அவர் முராத் பே மற்றும் இப்ராஹிம் பே ஆகியோரின் கூட்டுத் தாக்குதலை தோற்கடித்தார், பின்னர் அபூகிரில் ஒரு துருக்கிய இராணுவத்தை நசுக்கினார்.போனபார்டே எகிப்தை விட்டு வெளியேறினார், கிளெபரை தனது வாரிசாக நியமித்தார்.^[102] க்ளேபர் ஒரு ஆபத்தான சூழ்நிலையை எதிர்கொண்டார்.பிரெஞ்சு வெளியேற்றத்திற்கான ஆரம்ப ஒப்பந்தங்கள் ஆங்கிலேயர்களால் தடுக்கப்பட்ட பின்னர், கெய்ரோ கலவரங்களை அனுபவித்தது, அதை கிளெபர் அடக்கினார்.அவர் முராத் பேயுடன் பேச்சுவார்த்தை நடத்தினார், அவருக்கு மேல் எகிப்தின் கட்டுப்பாட்டை வழங்கினார், ஆனால் க்ளெபர் ஜூன் 1800 இல் படுகொலை செய்யப்பட்டார் ^[102]ஜெனரல் ஜாக்-பிரான்கோயிஸ் மெனு க்ளெபருக்குப் பிறகு, முஸ்லீம் ஆதரவைப் பெற முயன்றார், ஆனால் ஒரு பிரெஞ்சு பாதுகாப்பை அறிவித்து எகிப்தியர்களை அந்நியப்படுத்தினார்.1801 இல், ஆங்கிலேய மற்றும் துருக்கியப் படைகள் அபு கிரில் தரையிறங்கி, பிரெஞ்சு தோல்விகளுக்கு வழிவகுத்தது.ஜெனரல் பெல்லியார்ட் மே மாதம் கெய்ரோவை சரணடைந்தார், மேலும் மெனு ஆகஸ்ட் மாதம் அலெக்ஸாண்ட்ரியாவில் சரணடைந்தார், பிரெஞ்சு ஆக்கிரமிப்பை முடிவுக்குக் கொண்டுவந்தார்.^[102] பிரெஞ்சு ஆக்கிரமிப்பின் நீடித்த மரபு "Description de l'Egypte" ஆகும், இது பிரெஞ்சு அறிஞர்களால் எகிப்து பற்றிய விரிவான ஆய்வு ஆகும், இது எகிப்தியவியல் துறையில் குறிப்பிடத்தக்க பங்களிப்பை வழங்கியது.^[102]