După Culloden, forțele guvernamentale au petrecut câteva săptămâni căutând rebeli, confiscând vite și ardând casele de întâlnire episcopale și catolice care nu fac jură.Brutalitatea acestor măsuri a fost determinată de percepția larg răspândită de ambele părți că o altă aterizare era iminentă.Soldații obișnuiți aflați în serviciul francez au fost tratați ca prizonieri de război și ulterior schimbați, indiferent de naționalitate, dar 3.500 de iacobiți capturați au fost inculpați pentru trădare.Dintre aceștia, 120 au fost executați, în primul rând dezertori și membri ai Regimentului Manchester.Aproximativ 650 au murit în așteptarea procesului;900 au fost grațiați, iar restul transportați.