După ocuparea elamite a Babiloniei, regiunea a cunoscut schimbări politice semnificative, începând cu Marduk-kabit-ahheshu înființarea Dinastiei a IV-a a Babilonului în jurul anului 1155 î.Hr.Această dinastie, originară din Isin, s-a remarcat prin faptul că a fost prima dinastie nativă din Mesopotamia de Sud vorbitoare de akkadian care a condus Babilonia.Marduk-kabit-ahheshu, doar al doilea nativ mesopotamien după regele asirian Tukulti-Ninurta I care a condus Babilonul, i-a expulzat cu succes pe elamiți și a prevenit o renaștere casită.Domnia sa a fost, de asemenea, în conflict cu Asiria, cucerind Ekallatum înainte de a fi învins de Ashur-Dan I.Itti-Marduk-balatu, urmand tatălui său în 1138 î.Hr., a scăpat de atacurile elamite în timpul domniei sale de 8 ani.Încercările sale de a ataca Asiria, însă, s-au încheiat cu un eșec împotriva Ashur-Dan I. Ninurta-nadin-shumi, urcând pe tron ​​în 1127 î.Hr., a început și el în campanii militare împotriva Asiriei.Atacul său ambițios asupra orașului asirian Arbela s-a încheiat cu înfrângerea lui Ashur-resh-ishi I, care a impus apoi un tratat favorabil Asiriei.Nabucodonosor I (1124–1103 î.Hr.), cel mai renumit conducător al acestei dinastii, a obținut victorii semnificative împotriva Elamului, recâștigând teritorii și statuia sacră a lui Marduk.În ciuda succesului său împotriva lui Elam, el s-a confruntat cu mai multe înfrângeri de către Ashur-resh-ishi I în încercările de a se extinde în teritoriile controlate anterior de hitiți.Ultimii ani ai lui Nabucodonosor I s-au concentrat pe construcția și fortificarea granițelor Babilonului.Nebucadnețar I a fost urmat de Enlil-nadin-apli (1103–1100 î.Hr.) și Marduk-nadin-ahhe (1098-1081 î.Hr.), ambii implicați în conflicte cu Asiria.Succesele inițiale ale lui Marduk-nadin-ahhe au fost umbrite de înfrângerile zdrobitoare ale lui Tiglath-Pileser I, ducând la pierderi teritoriale substanțiale și la foamete în Babilon.Marduk-shapik-zeri (circa 1072 î.Hr.) a reușit să semneze un tratat de pace cu Asiria, dar succesorul său, Kadašman-Buriaš, s-a confruntat cu ostilitatea asiriană, rezultând dominația asiriană până în jurul anului 1050 î.Hr.Conducătorii babilonieni ulterioare precum Marduk-ahhe-eriba și Marduk-zer-X au fost în esență vasali ai Asiriei.Declinul Imperiului Asirian Mijlociu în jurul anului 1050 î.Hr., din cauza conflictelor interne și a conflictelor externe, a permis Babiloniei un oarecare răgaz de sub controlul asirian.Cu toate acestea, această perioadă a văzut și incursiunea popoarelor nomade semitice de vest, în special a arameilor și a suteilor, care s-au stabilit în mari părți ale teritoriului babilonian, indicând vulnerabilitățile politice și militare ale regiunii.