De Birmezen , onder leiding van koning Bayinnaung, veroverden Chiang Mai en begonnen daarmee een 200 jaar durende Birmese heerschappij over Lan Na.Er ontstonden conflicten over de Shan-staten, waarbij de expansionistische ambities van Bayinnaung leidden tot een invasie van Lan Na vanuit het noorden.In 1558 gaf Mekuti, de heerser van Lan Na, zich op 2 april 1558 over aan de Birmezen ^[.]Tijdens de Birmaans- Siamese oorlog (1563-1564) kwam Mekuti in opstand, aangemoedigd door Setthathirath.Hij werd echter in 1564 door Birmese troepen gevangengenomen en naar Pegu, destijds de Birmese hoofdstad, gebracht.Bayinnaung benoemde Wisutthithewi, een koninklijke Lan Na, tot de koningin van Lan Na na de dood van Mekuti.Later, in 1579, werd een van Bayinnaungs zonen, Nawrahta Minsaw, de ^{[onderkoning]} van Lan Na.Terwijl Lan Na enige autonomie genoot, controleerden de Birmezen de arbeid en de belastingen streng.Na het tijdperk van Bayinnaung viel zijn rijk uiteen.Siam kwam met succes in opstand (1584-1593), wat leidde tot de ontbinding van Pegu's vazallen in 1596-1597.Lan Na, onder Nawrahta Minsaw, riep de onafhankelijkheid uit in 1596 en werd in 1602 korte tijd een zijrivier van Siams koning Naresuan. Het gezag van Siam nam echter af na de dood van Naresuan in 1605, en tegen 1614 had het de nominale controle over Lan Na.Lan Na zocht hulp bij Lan Xang in plaats van bij Siam toen de Birmezen terugkeerden.^[19] Na 1614 regeerden vazalkoningen van Birmese afkomst meer dan een eeuw lang over Lan Na, ondanks Siams poging om de controle te laten gelden in 1662-1664, die uiteindelijk mislukte.