이란에 세워진 화라즈미 왕조는 징기스칸 의 몽골 침공 전까지만 지속되었습니다.1218년에는 빠르게 팽창하는 몽골 제국이 호라즈미안 영토와 접해 있었습니다.Khwarazmian 통치자 Ala ad-Din Muhammad는이란 대부분으로 자신의 영역을 확장하고 자신을 샤라고 선언하고 Abbasid 칼리프 Al-Nasir의 인정을 요청했지만 거부되었습니다.몽골의 이란 침공은 1219년 호라즘에 대한 그의 외교 임무가 학살된 이후 시작되었습니다.침략은 잔인하고 포괄적이었습니다.부하라(Bukhara), 사마르칸트(Samarkand), 헤라트(Herat), 투스(Tus), 니샤푸르(Nishapur)와 같은 주요 도시는 파괴되었고, 그곳의 주민들은 학살당했습니다.Ala ad-Din Muhammad는 도망쳐 결국 카스피해의 한 섬에서 사망했습니다.이 침공 동안 몽골인들은 중국 투석기 부대와 화약 폭탄을 사용하는 등 첨단 군사 기술을 사용했습니다.화약 기술에 능숙한 중국군은 몽골군에 속해 있었습니다.몽골의 정복으로 인해 화총(박격포)을 비롯한 중국의 화약 무기가 중앙아시아에 유입된 것으로 추정됩니다.후속 지역 문헌에서는중국 에서 사용되는 것과 유사한 화약 무기를 묘사했습니다.1227년 징기스칸의 죽음으로 정점을 이룬 몽골의 침공은 이란에게 엄청난 피해를 입혔습니다.이는 아제르바이잔 서부 도시의 약탈을 포함하여 심각한 파괴를 초래했습니다.몽골인들은 나중에 이슬람교로 개종하고 이란 문화에 동화되었음에도 불구하고 회복할 수 없는 피해를 입혔습니다.그들은 수세기에 걸쳐 이어져 온 이슬람 학문, 문화, 기반 시설을 파괴하고, 도시를 파괴하고, 도서관을 불태우고, 일부 지역에서는 모스크를 불교 사원으로 대체했습니다.^[38]이번 침공은 또한 이란의 민간인 생활과 국가 기반 시설에 치명적인 영향을 미쳤습니다.특히 이란 북동부의 카나트 관개 시스템이 파괴되면서 정착 형태가 붕괴되었고, 한때 번영했던 많은 농업 도시가 버려지게 되었습니다.^[39]징기스칸이 죽은 후 이란은 다양한 몽골 사령관의 통치를 받았습니다.징기스칸의 손자인 훌라구 칸(Hulagu Khan)은 몽골 세력을 서쪽으로 더욱 확장하는 일을 담당했습니다.그러나 그의 시대에 몽골 제국은 여러 세력으로 분열되어 있었습니다.훌라구는 80년 동안 통치하고 점점 페르시아화되는 몽골 제국의 이탈 국가인 이란에 일칸국을 세웠습니다.1258년 훌라구는 바그다드를 점령하고 마지막 아바스 왕조 칼리프를 처형했다.그의 확장은 1260년 Mamelukes에 의해 팔레스타인의 Ain Jalut 전투에서 중단되었습니다.또한, 무슬림에 대한 훌라구의 캠페인은 골든 호드(Golden Horde )의 무슬림 칸인 베르케(Berke)와의 갈등을 야기하여 몽골 통일의 붕괴를 부각시켰습니다.훌라구의 증손자인 가잔(r. 1295–1304) 치하에서 이슬람은 일칸국의 국교로 확립되었습니다.가잔은 이란의 고관 라시드 알딘(Rashid al-Din)과 함께 이란의 경제 부흥을 시작했습니다.그들은 장인에 대한 세금을 줄이고, 농업을 장려하고, 관개 작업을 복원하고, 무역로 보안을 강화하여 상업의 급증을 가져왔습니다.이러한 발전은 아시아 전역의 문화 교류를 촉진하고 이란 문화를 풍요롭게 했습니다.주목할만한 결과는 메소포타미아 와 중국의 예술적 요소를 혼합한 새로운 스타일의 이란 회화의 출현이었습니다.그러나 1335년 가잔의 조카 아부 사이드(Abu Said)가 사망한 후 일칸국(Ilkhanate)은 내전으로 전락하고 잘라이리드(Jalayirids), 무자파리드(Muzaffarids), 사르바다르(Sarbadars), 카르티드(Kartids)를 포함한 여러 개의 작은 왕조로 분열되었습니다.14세기에는 이란 인구의 약 30%가 사망한 흑사병의 파괴적인 영향도 목격되었습니다.^[40]