1988-ban, Zia-ul-Haq elnök halála után általános választásokkal helyreállították a demokráciát Pakisztánban.Ezek a választások a Pakisztáni Néppárt (PPP) visszatéréséhez vezettek, és Benazir Bhutto lett Pakisztán első női miniszterelnöke és az első női kormányfő egy muszlim többségű országban.Ezt az 1999-ig tartó időszakot a versengő kétpártrendszer jellemezte, a jobbközép konzervatívokat Nawaz Sharif, a balközép szocialisták pedig Benazir Bhutto vezetésével.Hivatali ideje alatt Bhutto átvezette Pakisztánt a hidegháború utolsó szakaszán, fenntartva a nyugatbarát politikát a kommunizmussal szembeni közös bizalmatlanság miatt.Kormánya szemtanúja volt a szovjet csapatok kivonásának Afganisztánból .A pakisztáni atombomba-projekt felfedezése azonban feszült kapcsolatokhoz vezetett az Egyesült Államokkal és gazdasági szankciók bevezetéséhez.Bhutto kormányának Afganisztánban is kihívásokkal kellett szembenéznie: egy sikertelen katonai beavatkozás a hírszerző szolgálatok igazgatóinak elbocsátásához vezetett.A gazdaság újjáélesztésére irányuló erőfeszítések ellenére, beleértve a hetedik ötéves tervet is, Pakisztán stagflációt tapasztalt, és Bhutto kormányát végül Ghulam Ishaq Khan konzervatív elnök menesztette.