A Hasmoneus polgárháború jelentős konfliktus volt a zsidó történelemben, amely a zsidó függetlenség elvesztéséhez vezetett.Ez egy hatalmi harcként indult két testvér, Hyrcanus és Aristobulus között, akik a Hasmoneus zsidó koronáért versengtek.Arisztobulus, a fiatalabb és ambiciózusabb, kapcsolatait felhasználva átvette az irányítást a fallal körülvett városok felett, és zsoldosokat fogadott fel, hogy királlyá nyilvánítsa magát, amíg anyjuk, Alexandra még élt.Ez az akció a két testvér összetűzését és polgári viszályok időszakát eredményezte.A nabateusok részvétele tovább bonyolította a konfliktust, amikor Idumean Antipatrosz meggyőzte Hyrkanust, hogy kérjen támogatást III. Aretastól, a nabateusok királyától.Hyrcanus alkut kötött Aretasszal, felajánlva 12 város visszaadását a nabateusoknak katonai segítségért cserébe.A nabateus erők támogatásával Hyrcanus szembeszállt Arisztobulusszal, ami Jeruzsálem ostromához vezetett.A római részvétel végül meghatározta a konfliktus kimenetelét.Mind Hyrcanus, mind Aristobulus támogatást kért a római tisztviselőktől, de Pompeius, egy római hadvezér végül Hyrcanus mellé állt.Ő ostrom alá vette Jeruzsálemet, és egy hosszú és heves csata után Pompeius erőinek sikerült áttörniük a város védelmét, ami Jeruzsálem elfoglalásához vezetett.Ez az esemény a Hasmoneus-dinasztia függetlenségének végét jelentette, mivel Pompeius visszaállította Hyrkanust főpapként, de megfosztotta királyi címétől, megszilárdítva a római befolyást Júdeában.Júdea autonóm maradt, de adót kellett fizetnie, és a szíriai római kormánytól függött.A királyságot feldarabolták;kénytelen volt lemondani a tengerparti síkságról, megfosztva a Földközi-tengerhez való hozzáféréstől, valamint Idumea és Szamária egyes részeitől.Több hellenisztikus város autonómiát kapott a Dekapolisz megalakításához, így az állam nagymértékben lecsökkent.