A 11. század végén a Khwarazmian-dinasztia vette át az irányítást Irak felett.A török ​​világi uralom és az Abbászida kalifátus időszaka a 13. századi mongol inváziókkal zárult.^[51] A Dzsingisz kán vezette mongolok 1221-re meghódították Khwarezmiát. Irak azonban átmeneti haladékot élt át Dzsingisz kán 1227-es halála és az azt követő hatalmi harcok miatt a Mongol Birodalomban.Möngke kán 1251-től újraindította a mongol terjeszkedést, és amikor al-Mustaszim kalifa megtagadta a mongol követeléseket, Bagdadot ostrom alá vette Hulagu kán vezette 1258-ban.Bagdad ostroma, a mongol hódítások döntő eseménye, 13 napig tartott 1258. január 29. és február 10. között. Az Ilkhanate mongol csapatai szövetségeseikkel együtt megostromolták, elfoglalták és végül kifosztották Bagdadot, az Abbászida kalifátus akkori fővárosát. .Ez az ostrom a város lakosságának nagy részének lemészárlását eredményezte, amelyek száma több százezerre tehető.Továbbra is vita tárgyát képezi a történészek körében a városi könyvtárak és értékes tartalmaik pusztulásának mértéke.A mongol erők kivégezték Al-Musta'simot, és súlyos elnéptelenedést és pusztítást okoztak Bagdadban.Ez az ostrom szimbolikusan az iszlám aranykor végét jelentette, amely időszak alatt a kalifák kiterjesztették uralmukat az Ibériai-félszigetről Szindre.