1863 januárjában a Potomac hadserege a fredericksburgi csatát és a megalázó sármenetet követően növekvő dezertálástól és morális romlástól szenvedett.Lincoln ötödször próbálkozott új tábornokkal 1863. január 25-én – őrnagy.Joseph Hooker tábornok, egy rossz hírű férfi, aki jól teljesített a korábbi beosztott parancsnokságokon.^[56]Hooker belefogott a hadsereg égetően szükséges átszervezésébe, megszüntetve Burnside nagy hadosztályrendszerét, amely nehézkesnek bizonyult;már nem volt elegendő magas rangú tisztje, akire megbízhatta volna a többhadtestből álló hadműveletek irányítását.^[57] A lovasságot külön hadtestté szervezte dandár parancsnoksága alatt.George Stoneman tábornok.Ám míg a lovasságot egyetlen szervezetbe tömörítette, tüzér zászlóaljait a gyalogos hadosztály parancsnokainak irányítása alá osztotta, megvonva a hadsereg tüzérfőnökének, dandárnak a koordinációs befolyását.Henry J. Hunt tábornok.Változásai között szerepelt a csapatok napi étrendjének javítása, a tábori higiéniai változtatások, a parancsnoki rendszer fejlesztése és elszámoltathatósága, a vállalati szakácsok hozzáadása és ellenőrzése, számos kórházi reform, továbbfejlesztett szabadságolási rendszer, parancsok a növekvő dezertálás megfékezésére, a gyakorlatok javítása. , és erősebb tisztképzés.A két sereg 1862–1863 telén Fredericksburgban szállt szembe egymással.A Chancellorsville-i hadjárat akkor kezdődött, amikor Hooker titokban felvitte serege nagy részét a Rappahannock folyó bal partján, majd 1863. április 27-én reggel átkelt rajta. George Stoneman vezérőrnagy vezette uniós lovasság hosszú távú rajtaütést indított ellene. Lee ellátási vezetékei nagyjából ugyanabban az időben.A Rapidan folyón Germannán és Ely Fordjain keresztül átkelve a szövetségi gyalogság április 30-án Chancellorsville közelében összpontosult. A Fredericksburggal szemben álló uniós haderővel együtt Hooker kettős beburkolást tervezett, Lee-t elölről és hátulról is megtámadva.Május 1-jén Hooker Chancellorsville-ből Lee felé nyomult, de a konföderációs tábornok a túlerővel szemben felosztotta seregét, és Fredericksburgnál egy kis haderőt hagyott hátra, hogy elriassza John Sedgwick vezérőrnagyot az előrenyomulástól, miközben körülbelül négyesével megtámadta Hooker előrenyomulását. -hadseregének ötödét.Beosztottjai ellenvetései ellenére Hooker visszavonta embereit a Chancellorsville körüli védelmi vonalakba, átengedve a kezdeményezést Lee-nek.Május 2-án Lee ismét felosztotta seregét, és Stonewall Jackson teljes hadtestét egy oldalsó menetre küldte, amely szétverte az Union XI hadtestet.A csata leghevesebb harca – és a polgárháború második legvéresebb napja – május 3-án zajlott le, amikor Lee többször is támadást indított az Unió állása ellen Chancellorsville-ben, ami mindkét oldalon súlyos veszteségeket és Hooker fő hadseregének visszahúzását eredményezte.Ugyanezen a napon Sedgwick előrenyomult a Rappahannock folyón, a második Fredericksburgi csatában legyőzte a kis konföderációs haderőt Marye's Heights-ben, majd nyugatra vonult.A Konföderáció sikeres késleltető akciót vívott a Salem Church-i csatában.4-én Lee hátat fordított Hookernek, megtámadta Sedgwicket, és visszahajtotta Banks Fordjához, három oldalról körülvéve őket.Sedgwick május 5-én korán visszavonult a fordon. Lee visszafordult, hogy szembeszálljon Hookerrel, aki május 5. és 6. közötti éjszakán visszavonta seregének maradékát az amerikai Fordon.Chancellorsville-t Lee "tökéletes csatájaként" ^[58] ismerik, mert kockázatos döntése, hogy felosztja seregét egy sokkal nagyobb ellenséges erő jelenlétében, jelentős konföderációs győzelmet eredményezett.A győzelmet Lee merészségének és Hooker félénk döntéshozatalának eredményeként súlyos veszteségek mérsékelték, köztük Thomas J. "Stonewall" Jackson altábornagy.Jacksont barátságos tűz érte, aminek következtében a bal karját amputálni kellett.Nyolc nappal később tüdőgyulladásban halt meg, amit Lee a jobb karja elvesztéséhez hasonlított.