מלחמת האזרחים בין שושלות Lê-Trịnh ו-Mạc הסתיימה בשנת 1592, כאשר צבאו של Trịnh Tùng כבש את האנוי והוציא להורג את המלך Mạc Mậu Hợp.ניצולי משפחת המלוכה Mạc נמלטו להרים הצפוניים במחוז קאו בנג והמשיכו לשלוט שם עד 1677 כאשר Trịnh Tạc כבש את הטריטוריה האחרונה של Mạc זה.המלכים Lê, מאז שיקומו של Nguyễn Kim, פעלו רק כדמויות.לאחר נפילת שושלת Mạc, כל הכוח האמיתי בצפון היה שייך לאדוני Trịnh.בינתיים, בית המשפט של מינג החליט בעל כורחו על התערבות צבאית במלחמת האזרחים הווייטנאמית, אך Mạc Đăng Dung הציע כניעה פולחנית לאימפריית מינג , שהתקבלה.בשנת 1600, Nguyễn Hoàng גם הכריז על עצמו אדון (באופן רשמי "Vương") וסירב לשלוח עוד כסף או חיילים כדי לעזור ל-Trịnh.הוא גם העביר את בירתו ל-Phú Xuân, Huế של ימינו.Trịnh Tráng ירש את Trịnh Tùng, אביו, עם מותו בשנת 1623. טראנג ציווה על Nguyễn Phúc Nguyên להיכנע לסמכותו.ההזמנה סורבה פעמיים.בשנת 1627, שלח Trịnh Tráng 150,000 חיילים דרומה במערכה צבאית לא מוצלחת.ה-Trịnh היו הרבה יותר חזקים, עם אוכלוסייה, כלכלה וצבא גדולים יותר, אך הם לא הצליחו להביס את ה-Nguyễn, שבנה שתי חומות אבן הגנה והשקיעו בארטילריה פורטוגזית.מלחמת Trịnh–Nguyễn נמשכה מ-1627 עד 1672. צבא Trịnh ביצע לפחות שבע התקפות, שכולן לא הצליחו ללכוד את Phú Xuân.במשך זמן מה, החל משנת 1651, בני הזוג Nguyễn עצמם יצאו למתקפה ותקפו חלקים משטח Trịnh.עם זאת, ה-Trịnh, תחת מנהיג חדש, Trịnh Tạc, אילץ את ה-Nguyễn בחזרה עד 1655. לאחר מתקפה אחרונה ב-1672, Trịnh Tạc הסכים להפוגה עם לורד Nguyễn Nguyễn Phúc Tạn.המדינה חולקה למעשה לשניים.מלחמת Trịnh–Nguyễn נתנה לסוחרים אירופאים את ההזדמנויות לתמוך בכל צד בנשק ובטכנולוגיה: הפורטוגלים סייעו ל- Nguyễn בדרום בעוד ההולנדים עזרו ל- Trịnh בצפון.ה-Trịnh וה-Nguyễn שמרו על שלום יחסי במשך מאה השנים הבאות, שבמהלכן שני הצדדים השיגו הישגים משמעותיים.ה-Trịnh יצר משרדי ממשלה מרכזיים שאחראים על תקציב המדינה וייצור מטבעות, איחד את יחידות המשקל למערכת עשרונית, הקים בתי דפוס כדי לצמצם את הצורך בייבוא ​​חומרים מודפסים מסין, פתח אקדמיה צבאית, וחיבר ספרי היסטוריה.בינתיים, האדונים של Nguyễn המשיכו בהתפשטות דרומה על ידי כיבוש אדמת צ'אם שנותרה.מתיישבי ויט הגיעו גם לאזור המאוכלס בדלילות המכונה "Water Chenla", שהיה החלק התחתון של דלתא המקונג של אימפריית החמר לשעבר.בין אמצע המאה ה-17 לאמצע המאה ה-18, כשהאימפריה החמרית לשעבר נחלשה על ידי סכסוכים פנימיים ופלישות סיאמיות , השתמשו הלורדים של נגוין באמצעים שונים, נישואים פוליטיים, לחץ דיפלומטי, טובות הנאה פוליטיות וצבאיות, כדי לזכות באזור הנוכחי. יום סייגון והדלתא של המקונג.צבא Nguyễn התנגש לעתים גם עם הצבא הסיאמי כדי לבסס השפעה על האימפריה החמרית לשעבר.