מ-1977 עד 1988 חוותה פקיסטן תקופה של שלטון צבאי תחת הגנרל זיא-אל-חק, המאופיינת בצמיחת השמרנות הדתית בחסות המדינה וברדיפות.זיא היה מחויב להקים מדינה אסלאמית ולאכוף את חוקי השריעה, להקים בתי דין שרעים נפרדים ולהנהיג חוקים פליליים אסלאמיים, לרבות עונשים קשים.האיסלאמיזציה הכלכלית כללה שינויים כמו החלפת תשלומי הריבית בחלוקת רווחים והטלת מס זכאת.שלטונו של זיא ראה גם את דיכוי ההשפעות הסוציאליסטיות ואת עליית הטכנוקרטיה, כאשר קציני צבא ממלאים תפקידים אזרחיים ומדיניות קפיטליסטית הוכנסה מחדש.תנועת השמאל בהובלת בוטו התמודדה עם דיכוי אכזרי, בעוד תנועות הפרדה בבלוצ'יסטן חוסלו.זיא ערך משאל עם ב-1984, והשיג תמיכה במדיניות הדתית שלו.יחסי החוץ של פקיסטן השתנו, עם הידרדרות הקשרים עם ברית המועצות ויחסים חזקים יותר עם ארצות הברית , במיוחד לאחר ההתערבות הסובייטית באפגניסטן .פקיסטן הפכה לשחקן מפתח בתמיכה בכוחות האנטי-סובייטיים, תוך ניהול זרם גדול של פליטים אפגנים והתמודדות עם אתגרים ביטחוניים.המתיחות עם הודו הסלימה, כולל סכסוכים על קרחון סיאצ'ן והתנוחה הצבאית.זיה השתמש בדיפלומטיית קריקט כדי להקל על המתיחות עם הודו והשמיע הצהרות פרובוקטיביות כדי להרתיע מפעולה צבאית הודית.תחת לחץ אמריקאי, זיא ביטל את החוק הצבאי ב-1985, מינה את מוחמד חאן ג'ונג'ו לראש ממשלה, אך מאוחר יותר פיטר אותו על רקע המתיחות הגוברת.זיא מת בהתרסקות מטוס מסתורית ב-1988, והותיר אחריו מורשת של השפעה דתית מוגברת בפקיסטן ושינוי תרבותי, עם עלייה במוסיקת הרוק המחתרתית המאתגרת את הנורמות השמרניות.