הדומיננטיות הסיאמית והווייטנאמית התגברה במהלך המאה ה-17 וה-18, וכתוצאה מכך תכופות של תזוזה של מושב השלטון, כאשר הסמכות המלכותית של החמר ירדה למצב של וסאל.סיאם, שאחרת הייתה יכולה להיות מחוזרת אליה כבעלת ברית נגד פלישות וייטנאמיות במאה ה-18, הייתה בעצמה מעורבת בסכסוכים ממושכים עם בורמה ובשנת 1767 נהרסה כליל בירת סיאמי, איוטאיה.עם זאת, סיאם התאוששה ועד מהרה החזירה את שליטתה בקמבודיה.מלך החמר הצעיר אנג אנג (1779–96) הותקן כמונרך באודונג בזמן שסיאם סיפחה את מחוזות בטאמבנג וסיאם ריפ בקמבודיה.השליטים המקומיים הפכו לווסלים תחת שלטון סיאמי ישיר.^[72]לסיאם ולווייטנאם היו עמדות שונות מהותית בנוגע ליחסיהן עם קמבודיה.הסיאמיים חלקו דת, מיתולוגיה, ספרות ותרבות משותפת עם החמר, לאחר שאימצו שיטות דת ותרבות רבות.^[73] מלכי צ'אקרי התאילנדי הלכו על פי שיטת הצ'קרוואטין של שליט אוניברסלי אידיאלי, השולט מבחינה אתית ומיטיבה על כל נתיניו.הווייטנאמים ביצעו משימה תרבותית, שכן הם ראו בעם החמר נחות מבחינה תרבותית וראו באדמות החמר מקום לגיטימי להתנחלות על ידי מתנחלים מוייטנאם.^[74]מאבק מחודש בין סיאם ווייטנאם על השליטה בקמבודיה ובאגן המקונג בתחילת המאה ה-19 הביא לשליטה וייטנאמית על מלך וסאל קמבודי.ניסיונות לאלץ את הקמבודים לאמץ מנהגים וייטנאמים גרמו למספר מרידות נגד השלטון הווייטנאמי.הבולט ביותר התרחש מ-1840 עד 1841, והתפשט ברוב הארץ.שטחה של דלתת המקונג הפך לסכסוך טריטוריאלי בין קמבודים וויאטנאמים.קמבודיה איבדה בהדרגה את השליטה על דלתא המקונג.