Une période de règne sous la maison suédoise de Vasa commença dans le Commonwealth en 1587. Les deux premiers rois de cette dynastie, Sigismond III (r. 1587-1632) et Władysław IV (r. 1632-1648), tentèrent à plusieurs reprises de intrigue pour l'accession au trône de Suède, qui était une source constante de distraction pour les affaires du Commonwealth.A cette époque, l’Église catholique se lance dans une contre-offensive idéologique et la Contre-Réforme réclame de nombreux convertis issus des milieux protestants polonais et lituaniens.En 1596, l'Union de Brest divise les chrétiens d'Orient du Commonwealth pour créer l'Église uniate de rite oriental, mais soumise à l'autorité du pape.La rébellion de Zebrzydowski contre Sigismond III s'est déroulée en 1606-1608.En quête de suprématie en Europe de l'Est, le Commonwealth a mené des guerres avec la Russie entre 1605 et 1618 à la suite de la période des troubles en Russie ;la série de conflits est appelée guerre polono-muscovite ou Dymitriades.Les efforts ont abouti à l'expansion des territoires orientaux du Commonwealth polono-lituanien, mais l'objectif de prendre le trône russe pour la dynastie dirigeante polonaise n'a pas été atteint.La Suède a cherché la suprématie dans la Baltique pendant les guerres polono-suédoises de 1617-1629, et l' Empire ottoman a été pressé du sud lors des batailles de Cecora en 1620 et de Khotyn en 1621. L'expansion agricole et les politiques de servage en Ukraine polonaise ont abouti à une série de des soulèvements cosaques .Allié à la monarchie des Habsbourg, le Commonwealth n'a pas participé directement à laguerre de Trente Ans. Le IVe règne de Władysław fut essentiellement pacifique, avec une invasion russe sous la forme de la guerre de Smolensk de 1632-1634 repoussée avec succès.La hiérarchie de l'Église orthodoxe, interdite en Pologne après l'Union de Brest, fut rétablie en 1635.