Μια περίοδος διακυβέρνησης υπό τον Σουηδικό Οίκο των Βάσα ξεκίνησε στην Κοινοπολιτεία το έτος 1587. Οι δύο πρώτοι βασιλιάδες από αυτή τη δυναστεία, ο Σιγισμούνδος Γ' (ρ. 1587-1632) και ο Βλαδίσλαβ Δ' (ρ. 1632-1648), προσπάθησαν επανειλημμένα να ίντριγκα για την άνοδο στο θρόνο της Σουηδίας, που αποτελούσε διαρκή πηγή αντιπερισπασμού για τις υποθέσεις της Κοινοπολιτείας.Εκείνη την εποχή, η Καθολική Εκκλησία ξεκίνησε μια ιδεολογική αντεπίθεση και η Αντιμεταρρύθμιση διεκδίκησε πολλούς προσήλυτους από Πολωνούς και Λιθουανούς προτεσταντικούς κύκλους.Το 1596, η Ένωση της Βρέστης διέλυσε τους Ανατολικούς Χριστιανούς της Κοινοπολιτείας για να δημιουργήσει την Ουνιτική Εκκλησία της Ανατολικής Τελετουργίας, αλλά υπό την εξουσία του Πάπα.Η εξέγερση του Zebrzydowski εναντίον του Sigismund III εκτυλίχθηκε το 1606-1608.Επιδιώκοντας την υπεροχή στην Ανατολική Ευρώπη, η Κοινοπολιτεία πολέμησε με τη Ρωσία μεταξύ 1605 και 1618 στον απόηχο της εποχής των προβλημάτων της Ρωσίας.η σειρά των συγκρούσεων αναφέρεται ως Πολωνομοσχοβιτικός Πόλεμος ή Διμητριάδες.Οι προσπάθειες είχαν ως αποτέλεσμα την επέκταση των ανατολικών εδαφών της Πολωνο-Λιθουανικής Κοινοπολιτείας, αλλά ο στόχος της κατάληψης του ρωσικού θρόνου για την Πολωνική δυναστεία δεν επιτεύχθηκε.Η Σουηδία επεδίωξε την υπεροχή στη Βαλτική κατά τη διάρκεια των πολωνο-σουηδικών πολέμων του 1617-1629, και η Οθωμανική Αυτοκρατορία πίεσε από το νότο στις μάχες στο Cecora το 1620 και στο Khotyn το 1621. Η αγροτική επέκταση και οι πολιτικές δουλοπαροικίας στην Πολωνική Ουκρανία οδήγησαν σε μια σειρά των εξεγέρσεων των Κοζάκων .Συμμαχώντας με τη μοναρχία των Αψβούργων, η Κοινοπολιτεία δεν συμμετείχε άμεσα στονΤριακονταετή Πόλεμο . Η IV βασιλεία του Władysław ήταν ως επί το πλείστον ειρηνική, με μια ρωσική εισβολή με τη μορφή του Πολέμου του Σμολένσκ του 1632–1634 που αποκρούστηκε επιτυχώς.Η ιεραρχία της Ορθόδοξης Εκκλησίας, που απαγορεύτηκε στην Πολωνία μετά την Ένωση της Βρέστης, επανιδρύθηκε το 1635.