Im frühen 16. Jahrhundert, nach der osmanischen Eroberung Ägyptens im Jahr 1517, ernannte Sultan Selim I. Yunus Pascha zum Gouverneur von Ägypten, der jedoch aufgrund von Korruptionsproblemen bald durch Hayır Bey ersetzt wurde.^[97] Diese Zeit war geprägt von einem Machtkampf zwischen den osmanischen Vertretern und denMamluken , die weiterhin erheblichen Einfluss hatten.Die Mamluken wurden in die Verwaltungsstruktur integriert und bekleideten Schlüsselpositionen in den 12 Sandschaks Ägyptens.Unter Sultan Suleiman dem Prächtigen wurden der Große Diwan und der Kleine Diwan zur Unterstützung des Paschas gegründet, vertreten durch die Armee und religiöse Autoritäten.Selim stellte sechs Regimenter zum Schutz Ägyptens auf, zu denen Suleiman ein siebtes hinzufügte.^[98]Die osmanische Regierung wechselte häufig den ägyptischen Gouverneur, oft jährlich.Ein Gouverneur, Hain Ahmed Pascha, versuchte die Unabhängigkeit zu erlangen, wurde jedoch vereitelt und hingerichtet.^[98] Im Jahr 1527 wurde in Ägypten eine Landvermessung durchgeführt, bei der Land in vier Arten eingeteilt wurde: die Domäne des Sultans, Lehen, militärisches Wartungsland und religiöse Stiftungsländer.Diese Erhebung wurde 1605 durchgeführt. ^[98]Das 17. Jahrhundert war in Ägypten von militärischen Meutereien und Konflikten geprägt, oft aufgrund von Versuchen, die Erpressung der Truppen einzudämmen.Im Jahr 1609 führte ein bedeutender Konflikt zum triumphalen Einzug von Kara Mehmed Pascha in Kairo, gefolgt von Finanzreformen.^[98] Während dieser Zeit erlangten lokale Mamluk-Beys die Vorherrschaft in der ägyptischen Verwaltung, bekleideten häufig militärische Positionen und forderten von den Osmanen ernannte Gouverneure heraus.^[99] Die ägyptische Armee hatte aufgrund ihrer starken lokalen Bindungen häufig Einfluss auf die Ernennung von Gouverneuren und hatte erhebliche Kontrolle über die Verwaltung.^[100]In diesem Jahrhundert entstanden auch zwei einflussreiche Fraktionen in Ägypten: die Faqari, die mit der osmanischen Kavallerie verbunden waren, und die Qasimi, die mit einheimischen ägyptischen Truppen verbunden waren.Diese Fraktionen, symbolisiert durch ihre unterschiedlichen Farben und Symbole, hatten erheblichen Einfluss auf die Regierungsführung und Politik des osmanischen Ägypten.^[101]