Mens interregnum, der fulgte det hedenske imperiums fald, varede over 250 år (1287-1555), var det efter First Taungoos fald relativt kortvarigt.En af Bayinnaungs sønner, Nyaungyan Min, påbegyndte straks genforeningsindsatsen, idet han med succes genoprettede den centrale myndighed over Øvre Burma og nærmere Shan-stater i 1606. Hans efterfølger Anaukpetlun besejrede portugiserne ved Thanlyin i 1613. Han genvandt den øvre Tanintharyi-kyst til Dawei og Lan Na fra siameserne i 1614. Han erobrede også de trans-Salween Shan-stater (Kengtung og Sipsongpanna) i 1622-26.Hans bror Thalun genopbyggede det krigshærgede land.Han bestilte den første folketælling nogensinde i burmesisk historie i 1635, som viste, at kongeriget havde omkring to millioner mennesker.I 1650 havde de tre dygtige konger – Nyaungyan, Anaukpetlun og Thalun – med succes genopbygget et mindre, men langt mere overskueligt kongerige.Endnu vigtigere er det, at det nye dynasti fortsatte med at skabe et juridisk og politisk system, hvis grundlæggende træk ville fortsætte under Konbaung-dynastiet langt ind i det 19. århundrede.Kronen erstattede fuldstændigt de arvelige høvdingeposter med udpegede guvernørposter i hele Irrawaddy-dalen og reducerede i høj grad Shan-høvdingernes arvelige rettigheder.Det tøjlede også den fortsatte vækst af klosterrigdom og autonomi, hvilket gav et større skattegrundlag.Dens handels- og sekulære administrative reformer byggede en fremgangsrig økonomi i mere end 80 år.^[55] Bortset fra nogle få lejlighedsvise oprør og en ekstern krig – Burma besejrede Siams forsøg på at tage Lan Na og Mottama i 1662-64 – var riget stort set i fred i resten af ​​det 17. århundrede.Kongeriget gik ind i et gradvist fald, og "paladskongernes" autoritet forværredes hurtigt i 1720'erne.Fra 1724 og fremefter begyndte Meitei-folket at angribe den øvre Chindwin-flod.I 1727 gjorde det sydlige Lan Na (Chiang Mai) med succes oprør og efterlod det nordlige Lan Na (Chiang Saen) under et stadig mere nominelt burmesisk styre.Meitei-angrebene intensiveredes i 1730'erne og nåede stadig dybere dele af det centrale Burma.I 1740 begyndte Mon i Nedre Burma et oprør og grundlagde det genoprettede Hanthawaddy Kongerige og kontrollerede i 1745 meget af Nedre Burma.Siameserne flyttede også deres autoritet op langs Tanintharyi-kysten i 1752. Hanthawaddy invaderede Øvre Burma i november 1751 og erobrede Ava den 23. marts 1752, hvilket afsluttede det 266 år gamle Taungoo-dynasti.