Folketællingen 1582-83 registrerede, at vilayet, en autonom del af grænsen til Sanjak of Scutari, havde nahiyah af Grbavci (13 landsbyer), Župa (11 landsbyer), Malonšići (7 landsbyer), Pješivci (14 landsbyer), Cetinje (16 landsbyer), Rijeka (31 landsbyer), Crmnica (11 landsbyer), Paštrovići (36 landsbyer) og Grbalj (9 landsbyer);i alt 148 landsbyer.De montenegrinske stammer udkæmpede med støtte fra det serbisk-ortodokse eparki Cetinje guerillakrige mod osmannerne med en vis grad af succes.Selvom osmannerne fortsat nominelt regerede landet, blev bjergene efter sigende aldrig blevet fuldstændig erobret.Der eksisterede stammeforsamlinger (zbor).Hovedbiskoppen (og stammelederne) allierede sig ofte med Republikken Venedig.Montenegrinerne kæmpede og vandt to vigtige slag ved Lješkopolje, i 1604 og 1613, under ledelse og kommando af Metropolitan Rufim Njeguš.Dette var det første slag, af mange, som en biskop havde ledet og formået at besejre osmannerne.Under den store tyrkiske krig, i 1685, ledede Suleiman, Pasha af Scutari, et kontingent, der nærmede sig Cetinje, og på vejen stødte sammen med hajduks i venetiansk tjeneste under kommando af Bajo Pivljanin ved bakken ved Vrtijeljka (i slaget ved Vrtijeljka) , hvor de udslettede hajdukerne.Bagefter paraderede de sejrrige osmannere med 500 afhuggede hoveder gennem Cetinje og angreb også Cetinje-klostret og Ivan Crnojevićs palads.Montenegrinerne fordrev osmannerne og hævdede uafhængighed efter den store tyrkiske krig (1683-1699).