Občanská válka mezi dynastií Lê-Trịnh a Mạc skončila v roce 1592, kdy armáda Trịnh Tùng dobyla Hanoj ​​a popravila krále Mạc Mậu Hợp.Přeživší královské rodiny Mạc uprchli do severních hor v provincii Cao Bằng a nadále tam vládli až do roku 1677, kdy Trịnh Tạc dobyl toto poslední území Mạc.Monarchové Lê se od navrácení Nguyễn Kima chovali pouze jako loutky.Po pádu dynastie Mạc patřila veškerá skutečná moc na severu pánům Trịnh.Mezitím mingský soud neochotně rozhodl o vojenské intervenci do vietnamské občanské války, ale Mạc Đăng Dung nabídl rituální podrobení říši Ming , což bylo přijato.V roce 1600 se Nguyễn Hoàng také prohlásil za Lorda (oficiálně „Vương“) a odmítl poslat další peníze nebo vojáky na pomoc Trịnh.Přestěhoval také své hlavní město do Phú Xuân, dnešního Huế.Trịnh Tráng následoval Trịnh Tùng, jeho otec, po jeho smrti v roce 1623. Tráng nařídil Nguyễn Phúc Nguyênovi, aby se podřídil jeho autoritě.Objednávka byla dvakrát odmítnuta.V roce 1627 poslal Trịnh Tráng 150 000 vojáků na jih v neúspěšné vojenské kampani.Trịnh byli mnohem silnější, s větší populací, ekonomikou a armádou, ale nebyli schopni porazit Nguyễn, který postavil dvě obranné kamenné zdi a investoval do portugalského dělostřelectva.Trịnh-Nguyễn válka trvala od 1627 dokud ne 1672. Trịnh armáda představila přinejmenším sedm útoků, všichni který nedokázal zachytit Phú Xuân.Na nějakou dobu, počínaje rokem 1651, sami Nguyễn přešli do útoku a zaútočili na části území Trịnh.Nicméně, Trịnh, pod novým vůdcem, Trịnh Tạc, donutil Nguyễn zpět do roku 1655. Po poslední ofenzívě v roce 1672 Trịnh Tạc souhlasil s příměřím s Nguyễn Lordem Nguyễn Phúc Tần.Země byla fakticky rozdělena na dvě části.Válka Trịnh–Nguyễn poskytla evropským obchodníkům příležitosti podporovat obě strany zbraněmi a technologií: Portugalci pomáhali Nguyễnům na jihu, zatímco Nizozemci pomáhali Trịnh na severu.Trịnh a Nguyễn udržovaly relativní mír po dalších sto let, během kterých obě strany dosáhly významných úspěchů.Trịnh vytvořil centralizované vládní úřady, které měly na starosti státní rozpočet a produkoval měnu, sjednotil váhové jednotky do desítkové soustavy, založil tiskárny, aby snížil potřebu dovážet tištěné materiály z Číny, otevřel vojenskou akademii a sestavil historické knihy.Mezitím lordi Nguyễn pokračovali v expanzi na jih dobytím zbývající země Cham.Việtští osadníci také dorazili do řídce osídlené oblasti známé jako „Water Chenla“, což byla nižší část delty Mekongu bývalé Khmerské říše .Mezi polovinou 17. století a polovinou 18. století, kdy bývalá khmerská říše byla oslabena vnitřními spory a siamskými invazemi, používali Nguyễnští lordi různé prostředky, politické sňatky, diplomatický tlak, politickou a vojenskou přízeň, aby získali oblast kolem současnosti. - den Saigon a delta Mekongu.Nguyễnská armáda se občas také střetla se siamskou armádou, aby vytvořila vliv na bývalou Khmerskou říši.