V roce 1958 skončil pákistánský parlamentní systém vyhlášením stanného práva.Veřejné rozčarování z korupce v občanské byrokracii a administrativě vedlo k podpoře akcí generála Ayuba Khana.^[16] Vojenská vláda provedla významné pozemkové reformy a prosadila nařízení o diskvalifikaci volených orgánů, které zakazovalo HS Suhrawardymu z veřejné funkce.Khan představil „základní demokracii“, nový prezidentský systém, kde 80 000 voličů vybralo prezidenta a vyhlásilo ústavu z roku 1962.^[17] V roce 1960 získal Ayub Khan lidovou podporu v národním referendu a přešel z vojenské na ústavní civilní vládu.^[16]Významný vývoj během předsednictví Ajub Khana zahrnoval přemístění infrastruktury hlavního města z Karáčí do Islámábádu.Tato éra, známá jako „Velká dekáda“, je oslavována pro svůj ekonomický rozvoj a kulturní posuny, ^[18] včetně vzestupu populární hudby, filmu a dramatického průmyslu.Ayub Khan spojil Pákistán se Spojenými státy a západním světem a připojil se k Central Treaty Organization (CENTO) a Southeast Asia Treaty Organization (SEATO).Soukromý sektor rostl a země udělala pokroky ve vzdělávání, lidském rozvoji a vědě, včetně zahájení vesmírného programu a pokračování programu jaderné energetiky.^[18]Incident špionážního letadla U2 v roce 1960 však odhalil tajné operace USA z Pákistánu, což ohrozilo národní bezpečnost.V témže roce Pákistán podepsal s Indií smlouvu o vodách Indus za účelem normalizace vztahů.^[19] Vztahy s Čínou se posílily, zejména po čínsko-indické válce, což vedlo v roce 1963 k dohodě o hranicích, která posunula dynamiku studené války .V roce 1964 pákistánské ozbrojené síly potlačily podezřelou prokomunistickou vzpouru v západním Pákistánu a v roce 1965 Ayub Khan těsně vyhrál kontroverzní prezidentské volby proti Fatimě Jinnah.