Asiya genetikasına dair bir araşdırma, Şərqi Asiyada orijinal insanların Cənub-Şərqi Asiyadan gəldiyini göstərir.^[14] Yarımadadakı yerli qrupları üç etnosa bölmək olar: Neqritoslar, Senoilər və proto-Malaylar.^[15] Malay yarımadasının ilk sakinləri çox güman ki, Neqritoslar idi.^[16] Bu mezolit ovçuları, ehtimal ki, etnik Neqrito qrupunun Semangların əcdadları idi.^[17] Senoi birləşmiş qrup kimi görünür, ana mitoxondrial DNT nəsillərinin təxminən yarısı Semangların əcdadlarına və təxminən yarısı Hind-Çindən sonrakı əcdadların miqrasiyalarına qədər uzanır.Alimlər onların təxminən 4000 il əvvəl həm dillərini, həm də texnologiyalarını yarımadanın cənub hissəsinə gətirmiş erkən avstroasiatik dilli əkinçilərin nəslindən olduqlarını irəli sürürlər.Onlar yerli əhali ilə birləşərək birləşdilər.^[18] Proto Malaylar daha müxtəlif mənşəlidir ^[19] və Avstroneziya genişlənməsi nəticəsində eramızdan əvvəl 1000-ci ilə qədər Malayziyada məskunlaşmışdılar.^[20] Dəniz Cənub-Şərqi Asiyadakı digər sakinlərlə müəyyən əlaqələr göstərsələr də, bəzilərinin də təxminən 20.000 il əvvəl Son Buzlaq Maksimum zamanı Hind-Çinində əcdadları var.Dəniz Jade Yolunda indi Malayziyanın ərazisini əhatə edən ərazilər iştirak etdi.Ticarət şəbəkəsi eramızdan əvvəl 2000-ci ildən 1000-ci ilə qədər 3000 il ərzində mövcud olmuşdur.^[21]Antropoloqlar Proto-Malayların indiki Yunnan,Çindən yarandığı fikrini dəstəkləyirlər.^[22] Bunun ardınca Malay yarımadası vasitəsilə Malay arxipelaqına erkən Holosen dağılımı gəldi.^[23] Təxminən eramızdan əvvəl 300-cü ildə onlar qismən Kamboca və Vyetnam Çamlarından gələn Dəmir dövrü və ya Tunc dövrünə aid olan Deutero-Malaylar tərəfindən ölkə daxilində sıxışdırıldılar.Yarımadada metal alətlərdən istifadə edən ilk qrup Deutero-Malays bugünkü Malayziya Malayziyasının birbaşa əcdadları idi və özləri ilə qabaqcıl əkinçilik texnikasını gətirdilər.^[17] Ümumi mədəniyyət və sosial quruluş ortaq olmasına baxmayaraq, Malaylar Malay arxipelaqı boyunca siyasi cəhətdən parçalanmış vəziyyətdə qaldılar.^[24]