准噶尔种族灭绝是清朝对蒙古准噶尔人的大规模灭绝。1755年，准噶尔首领阿穆尔萨纳反抗清朝统治，乾隆皇帝在阿穆尔萨纳的支持下首次征服了准噶尔汗国，下令进行种族灭绝。由于维吾尔族反抗准噶尔统治，清军派去镇压准噶尔人的满族将军在维吾尔族盟友和附庸的支持下实施了种族灭绝。准噶尔汗国是17世纪初出现的几个藏传佛教卫拉特蒙古部落的联盟，是亚洲最后一个伟大的游牧帝国。一些学者估计，大约 80% 的准噶尔人口，即大约 500,000 至 800,000 人，在 1755 年至 1757 年清朝征服期间或之后死于战争和疾病。清政府消灭了准噶尔原住民后，又将汉族、回族、维吾尔族、锡伯族和满族旗人重新安置在准噶尔的国营农场里。