墨西哥在帕洛阿尔托和雷萨卡德拉帕尔马的失败为桑塔·安娜的回归奠定了基础，桑塔·安娜在战争爆发时流亡到了古巴。他写信给墨西哥城政府，表示他不想重返总统职位，但他想结束古巴的流亡，利用他的军事经验为墨西哥夺回德克萨斯州。法里亚斯总统陷入了绝望。他接受了这个提议并允许桑塔·安娜回来。法里亚斯不知道的是，圣安娜一直在秘密与美国代表打交道，讨论以合理的价格将所有有争议的领土出售给美国，条件是允许他通过美国的海上封锁返回墨西哥。波尔克派了自己的代表亚历山大·斯利德尔·麦肯齐前往古巴，直接与圣安娜进行谈判。谈判是秘密进行的，会议没有书面记录，但会议中达成了一些谅解。波尔克要求国会提供 200 万美元用于与墨西哥的条约谈判。美国允许圣安娜返回墨西哥，解除了墨西哥湾沿岸的海上封锁。然而，在墨西哥，圣安娜否认与美国代表会面或任何要约或交易的情况。他没有成为波尔克的盟友，而是把给他的钱都装进了自己的口袋，并开始计划墨西哥的防御。包括斯科特将军在内的美国人都感到沮丧，因为这是一个意想不到的结果。“圣安娜对他的敌人的天真感到幸灾乐祸：‘美国被欺骗了，他们相信我有能力背叛我的祖国。’”圣安娜避免卷入政治，致力于墨西哥的军事防御。当政客们试图将治理框架重置为联邦共和国时，圣安娜前往前线夺回失去的北部领土。尽管圣安娜于 1846 年当选总统，但他拒绝执政，将权力留给副总统，同时他试图与泰勒的军队接触。随着联邦共和国的恢复，一些州拒绝支持圣安娜领导的全国军事行动，而圣安娜在过去十年中曾与他们直接作战。圣安娜敦促副总统戈麦斯·法里亚斯充当独裁者，以获取战争所需的人员和物资。戈麦斯·法里亚斯强迫天主教会贷款，但资金未能及时用于支持圣安娜的军队。