蒙特雷战役后，美国人占领了加利福尼亚州北部，但何塞·玛丽亚·卡斯特罗将军和州长皮奥·皮科计划在南部洛杉矶地区进行抵抗。海军准将罗伯特·F·斯托克顿 (Robert F. Stockton) 于 7 月 15 日搭乘国会号抵达蒙特利湾，并接替约翰·D·斯洛特 (John D. Sloat) 指挥。斯托克顿接受约翰·C·弗里蒙特少校指挥的熊旗革命者为加州营。斯托克顿随后驻守索诺玛、圣胡安包蒂斯塔、圣克拉拉和萨特堡。斯托克顿对付卡斯特罗的计划是让指挥官塞缪尔·弗朗西斯·杜邦将弗里蒙特的部队从氰河带到圣地亚哥，以阻止任何向南的行动，而斯托克顿将在圣佩德罗登陆一支部队，从陆路进攻卡斯特罗。弗里蒙特于7月29日抵达圣地亚哥，并于8月6日乘坐国会号抵达圣佩德罗。1846 年 8 月 13 日，斯托克顿率领纵队进城，半小时后弗里蒙特的部队紧随其后。8月14日，加州军队残部投降。9月23日，塞尔布洛·巴雷拉（Cerbulo Varela）指挥的20名男子在总督府与美国人交火，点燃了洛杉矶。9 月 24 日，150 名加州人，由仍留在加州的墨西哥军官何塞·玛丽亚·弗洛雷斯 (José María Flores) 在卡斯特罗位于拉梅萨的旧营地组织。吉莱斯皮的部队实际上被围困了，而吉莱斯皮派胡安·“弗拉科”·布朗向斯托克顿准将寻求帮助。9 月 28 日，吉莱斯皮的部队撤退到山堡，但由于没有水，他们于第二天投降。根据条款要求，吉莱斯皮的部下于 1846 年 9 月 30 日离开洛杉矶，登上美国商船“万达利亚”号。弗洛雷斯迅速清除了南加州剩余的美军。