Sau Culloden, các lực lượng chính phủ đã dành vài tuần để tìm kiếm những kẻ nổi loạn, tịch thu gia súc và đốt cháy các nhà họp của người Công giáo và Giám mục không thành công.Sự tàn bạo của các biện pháp này được thúc đẩy bởi nhận thức rộng rãi của cả hai bên rằng một cuộc đổ bộ khác sắp xảy ra.Những người lính chính quy phục vụ cho Pháp được coi như tù nhân chiến tranh và sau đó được trao đổi, bất kể quốc tịch, nhưng 3.500 người Jacobite bị bắt đã bị truy tố vì tội phản quốc.Trong số này, 120 người đã bị hành quyết, chủ yếu là lính đào ngũ và thành viên của Trung đoàn Manchester.Khoảng 650 người chết trong khi chờ xét xử;900 đã được ân xá và phần còn lại vận chuyển.