Sau khi người Elamite chiếm đóng Babylonia, khu vực này đã chứng kiến ​​những thay đổi chính trị quan trọng, bắt đầu từ việc Marduk-kabit-ahheshu thành lập Vương triều IV của Babylon vào khoảng năm 1155 trước Công nguyên.Triều đại này, có nguồn gốc từ Isin, nổi tiếng vì là triều đại Nam Lưỡng Hà nói tiếng Akkad bản địa đầu tiên cai trị Babylonia.Marduk-kabit-ahheshu, người Lưỡng Hà bản địa thứ hai sau vua Assyria Tukulti-Ninurta I cai trị Babylon, đã trục xuất thành công người Elamite và ngăn chặn sự hồi sinh của người Kassite.Triều đại của ông cũng chứng kiến ​​xung đột với Assyria, chiếm Ekallatum trước khi bị Ashur-Dan I đánh bại.Itti-Marduk-balatu, người kế vị cha mình vào năm 1138 trước Công nguyên, đã chống lại các cuộc tấn công của người Elamite trong suốt 8 năm trị vì của mình.Tuy nhiên, những nỗ lực tấn công Assyria của ông đã kết thúc trong thất bại trước Ashur-Dan I. Ninurta-nadin-shumi, người vẫn đang trị vì, lên ngôi vào năm 1127 trước Công nguyên, cũng bắt tay vào các chiến dịch quân sự chống lại Assyria.Cuộc tấn công đầy tham vọng của ông vào thành phố Arbela của Assyria đã kết thúc với thất bại trước Ashur-resh-ishi I, người sau đó đã áp đặt một hiệp ước có lợi cho Assyria.Nebuchadnezzar I (1124–1103 TCN), người cai trị nổi tiếng nhất của triều đại này, đã đạt được những chiến thắng quan trọng trước Elam, giành lại lãnh thổ và bức tượng thiêng liêng của Marduk.Bất chấp thành công trước Elam, anh ta phải đối mặt với nhiều thất bại trước Ashur-resh-ishi I trong nỗ lực mở rộng sang các lãnh thổ trước đây do người Hittite kiểm soát.Những năm sau này của Nebuchadnezzar I tập trung vào việc xây dựng và củng cố biên giới của Babylon.Tiếp theo Nebuchadnezzar I là Enlil-nadin-apli (1103–1100 TCN) và Marduk-nadin-ahhe (1098–1081 TCN), cả hai đều có xung đột với Assyria.Những thành công ban đầu của Marduk-nadin-ahhe đã bị lu mờ trước những thất bại nặng nề trước Tiglath-Pileser I, dẫn đến tổn thất đáng kể về lãnh thổ và nạn đói ở Babylon.Marduk-shapik-zeri (khoảng năm 1072 TCN) đã cố gắng ký được một hiệp ước hòa bình với Assyria, nhưng người kế nhiệm ông, Kadašman-Buriaš, phải đối mặt với sự thù địch của người Assyria, dẫn đến sự thống trị của người Assyria cho đến khoảng năm 1050 TCN.Những người cai trị Babylon sau này như Marduk-ahhe-eriba và Marduk-zer-X về cơ bản là chư hầu của Assyria.Sự suy tàn của Đế chế Trung Assyria vào khoảng năm 1050 trước Công nguyên, do xung đột nội bộ và xung đột bên ngoài, đã cho phép Babylonia có một chút thời gian nghỉ ngơi khỏi sự kiểm soát của người Assyria.Tuy nhiên, thời kỳ này cũng chứng kiến ​​sự xâm nhập của các dân tộc du mục Tây Semit, đặc biệt là người Aram và người Sutean, những người định cư trên phần lớn lãnh thổ Babylon, cho thấy những điểm yếu về chính trị và quân sự của khu vực.