7 Ocak 1598'de çocuksuz Feodor'un ölümü ve Feodor'un çok daha küçük olan kardeşi Dimitry'nin suikasta kurban gitmesi, Boris'in iktidara gelmesine yol açtı.Onun seçilmesi, Boris'in durumun zorluklarıyla başa çıkabilecek tek kişi olduğuna inanan Moskova Patriği Job tarafından önerildi.Ancak Boris, tahtı yalnızca 17 Şubat'ta toplanan ve 21 Şubat'ta oybirliğiyle seçen Zemsky Sobor'dan (ulusal meclis) kabul edecekti.1 Eylül'de ciddiyetle çar olarak taç giydi.Rusya'nın Batı'nın entelektüel ilerlemesini yakalaması gerektiğini anladı ve eğitim ve sosyal reformları gerçekleştirmek için elinden gelenin en iyisini yaptı.Büyük çapta yabancı öğretmenler ithal eden, genç Rusları eğitim görmeleri için yurtdışına ilk gönderen ve Rusya'da Lutheran kiliselerinin inşa edilmesine ilk izin veren ilk çardı.