Kral Bayinnaung liderliğindeki Burmalılar Chiang Mai'yi fethederek Lan Na üzerinde 200 yıllık Burma egemenliğini başlattı.Bayinnaung'un yayılmacı hırslarının kuzeyden Lan Na'nın işgaline yol açmasıyla Shan eyaletleri üzerinde çatışma çıktı.1558 yılında Lan Na hükümdarı Mekuti, 2 Nisan 1558'de Birmanya'ya teslim oldu ^[.17]Burma- Siyam Savaşı (1563-64) sırasında Mekuti, Setthathirath'ın teşvikiyle isyan etti.Ancak 1564 yılında Birmanya güçleri tarafından yakalanıp o zamanki Birmanya'nın başkenti Pegu'ya götürüldü.Bayinnaung, Mekuti'nin ölümünden sonra Lan Na kraliyetinden Wisutthithewi'yi Lan Na'nın kraliçesi olarak atadı.Daha sonra 1579'da Bayinnaung'un oğullarından biri olan Nawrahta Minsaw ^[18] Lan Na'nın genel valisi oldu.Lan Na bir miktar özerkliğe sahipken, Burmalılar emeği ve vergiyi sıkı bir şekilde kontrol ediyordu.Bayinnaung'un döneminin ardından imparatorluğu parçalandı.Siam başarılı bir şekilde isyan etti (1584-93), bu da Pegu'nun vasallarının 1596-1597'de dağılmasına yol açtı.Nawrahta Minsaw yönetimindeki Lan Na, 1596'da bağımsızlığını ilan etti ve 1602'de kısa süreliğine Siam Kralı Naresuan'ın kolu haline geldi. Ancak Siam'ın otoritesi, Naresuan'ın 1605'teki ölümünden sonra azaldı ve 1614'te Lan Na üzerinde nominal kontrole sahipti.Lan Na, Burmalılar geri döndüğünde Siam yerine Lan Xang'dan yardım istedi.Siam'ın 1662-1664'te kontrolü ele geçirme girişimine rağmen, sonuçta ^{[başarısız]} olan Burma kökenli vasal krallar, 1614'ten sonraki bir yüzyıl boyunca Lan Na'yı yönetti.