Fransa-Tayland savaşı sona erdikten sonra Tayland hükümeti tarafsızlığını ilan etti.Japonlar , Pearl Harbor saldırısından birkaç saat sonra, 8 Aralık 1941'de Tayland'ı işgal ettiğinde, Japonya, birliklerini Tayland üzerinden Malaya sınırına taşıma hakkını talep etti.Phibun, kısa bir direnişin ardından Japon taleplerini kabul etti.Hükümet, Aralık 1941'de askeri bir ittifak imzalayarak Japonya ile ilişkilerini geliştirdi. Japon orduları, Burma ve Malaya'yı işgal ederken ülkeyi üs olarak kullandı.^[Ancak] Japonlar Malaya'da "Bisiklet Blitzkrieg" ile şaşırtıcı derecede az dirençle ilerledikten sonra tereddüt yerini coşkuya bıraktı.^[64] Ertesi ay Phibun, Britanya ve ABD'ye savaş ilan etti.Güney Afrika ve Yeni Zelanda aynı gün Tayland'a savaş ilan etti.Avustralya kısa süre sonra onu takip etti.^[65] Japon ittifakına karşı çıkan herkes hükümetinden kovuldu.Pridi Phanomyong, bulunmayan Kral Ananda Mahidol'ün vekili olarak atanırken, Japonlara karşı direnişin devam etmesini savunan önde gelen dışişleri bakanı Direk Jayanama daha sonra büyükelçi olarak Tokyo'ya gönderildi.ABD, Tayland'ı Japonya'nın kuklası olarak gördü ve savaş ilan etmeyi reddetti.Müttefikler galip geldiğinde ABD, Britanya'nın cezalandırıcı bir barış dayatma çabalarını engelledi.^[66]Taylandlılar ve Japonlar, Shan Eyaleti ve Kayah Eyaletinin Tayland kontrolü altında olması konusunda anlaştılar.10 Mayıs 1942'de Tayland Phayap Ordusu Burma'nın doğu Shan Eyaletine girdi, Tayland Burma Bölgesi Ordusu Kayah Eyaletine ve Burma'nın merkezinin bazı bölgelerine girdi.Zırhlı keşif gruplarının öncülüğünü yaptığı ve hava kuvvetleri tarafından desteklenen üç Tayland piyadesi ve bir süvari tümeni, geri çekilen Çin 93. Tümeni ile çatışmaya girdi.Ana hedef olan Kengtung 27 Mayıs'ta ele geçirildi.Haziran ve Kasım aylarında yenilenen saldırılar, Çin'in Yunnan'a çekilmesine neden oldu.^[67] Shan Eyaletleri ve Kayah Eyaletlerini içeren bölge 1942'de Tayland tarafından ilhak edildi. 1945'te Burma'ya geri verilecekti.Seri Thai (Özgür Tayland Hareketi), Tayland'ın Washington büyükelçisi Seni Pramoj tarafından kurulan, Japonya'ya karşı bir yeraltı direniş hareketiydi.Tayland'ın içinden vekil Pridi'nin ofisinden yönetilen örgüt, çoğunlukla Prens Chula Chakrabongse gibi kraliyet ailesinin üyelerinin ve hükümet üyelerinin desteğiyle, özgürce faaliyet gösteriyordu.Japonya yenilgiye yaklaşırken ve Japon karşıtı yeraltı direnişi Seri Thai giderek güçlenirken, Ulusal Meclis Phibun'u görevden aldı.Altı yıllık başkomutanlık saltanatı sona ermişti.İstifası kısmen iki büyük planının ters gitmesinden kaynaklandı.Bunlardan biri, başkentin Bangkok'tan kuzey-orta Tayland'daki Phetchabun yakınlarındaki ormandaki uzak bir bölgeye taşınmasıydı.Diğeri ise Saraburi yakınlarında bir "Budist şehri" inşa etmekti.Ciddi ekonomik sıkıntıların olduğu bir dönemde açıklanan bu fikirler birçok hükümet yetkilisini ona karşı yöneltti.^[68]Savaşın sonunda Phibun, Müttefiklerin ısrarı üzerine, başta Mihver güçleriyle işbirliği olmak üzere savaş suçları işlediği suçlamasıyla yargılandı.Ancak kamuoyunun yoğun baskısıyla beraat etti.Tayland'ın çıkarlarını korumak için elinden gelenin en iyisini yaptığı, özellikle de Malaya ve Burma'daki Tayland topraklarının genişlemesini desteklemek için Japonya ile ittifakı kullandığı düşünüldüğü için kamuoyu hala Phibun'dan yanaydı.^[69]