1991-1995 Bosna Savaşı ve Hırvat Savaşı sırasında Karadağ, polis ve askeri güçleriyle birlikte Dubrovnik, Hırvatistan ve Bosna kasabalarına yönelik saldırılara Sırp birliklerinin yanı sıra katıldı; bu, güç kullanarak daha fazla toprak ele geçirmeyi amaçlayan saldırgan eylemlerdi ve tutarlı bir saldırganlık modeliyle karakterize ediliyordu. Ağır ve sistematik insan hakları ihlalleri.Karadağlı General Pavle Strugar o zamandan beri Dubrovnik'in bombalanmasındaki rolünden dolayı mahkum edildi.Bosnalı mülteciler Karadağ polisi tarafından tutuklanarak Foça'daki Sırp kamplarına nakledildiler ve orada sistematik işkenceye maruz kalıp idam edildiler.Mayıs 1992'de Birleşmiş Milletler FRY'ye ambargo uyguladı: bu, ülkedeki yaşamın birçok yönünü etkiledi.Elverişli coğrafi konumu nedeniyle (Adriyatik Denizi'ne erişim ve Skadar Gölü üzerinden Arnavutluk'a su bağlantısı) Karadağ, kaçakçılık faaliyetleri için bir merkez haline geldi.Karadağ'ın tüm endüstriyel üretimi durmuştu ve cumhuriyetin ana ekonomik faaliyeti kullanıcı mallarının kaçakçılığı haline geldi; özellikle de petrol ve sigara gibi arzı yetersiz olan ve her ikisinin de fiyatları hızla artan malların kaçakçılığı.Bu fiilen yasallaştırılmış bir uygulama haline geldi ve yıllarca devam etti.Karadağ hükümeti en iyi ihtimalle yasadışı faaliyete göz yumdu, ancak çoğunlukla bu faaliyette aktif rol aldı.Kaçakçılık, üst düzey hükümet yetkilileri de dahil olmak üzere her türden şüpheli kişiyi milyoner yaptı.Milo Đukanović, 1990'larda yaygın kaçakçılıktaki rolü ve aynı zamanda kaçakçılık dağıtım zincirinde yer aldığı iddia edilen farklı İtalyan Mafyası figürleri için Karadağ'da güvenli sığınak sağlamadaki rolü nedeniyle çeşitli İtalyan mahkemelerinde davalarla karşı karşıya kalmaya devam ediyor.