Yeşil Kraliçe Raja Hijau, erkek varis eksikliği nedeniyle 1584 yılında Patani tahtına çıktı.Siyam otoritesini kabul etti ve peracau unvanını benimsedi.Onun 32 yıl süren yönetimi altında Patani zenginleşerek bir kültür merkezi ve önemli bir ticaret merkezi haline geldi.Çinli, Malaylı, Siyamlı, Portekizli, Japon, Hollandalı ve İngiliz tüccarlar Patani'ye uğrayarak ekonomik büyümesine katkıda bulundular.Özellikle Çinli tüccarlar Patani'nin bir ticaret merkezi olarak yükselişinde önemli bir rol oynadılar ve Avrupalı ​​tüccarlar Patani'yi Çin pazarına açılan bir kapı olarak gördüler.Raja Hijau'nun saltanatının ardından Patani, Raja Biru (Mavi Kraliçe), Raja Ungu (Mor Kraliçe) ve Raja Kuning (Sarı Kraliçe) dahil olmak üzere bir dizi kraliçe tarafından yönetildi.Raja Biru, Kelantan Sultanlığı'nı Patani'ye dahil ederken Raja Ungu ittifaklar kurdu ve Siyam egemenliğine direnerek Siam'la çatışmalara yol açtı.Raja Kuning'in hükümdarlığı Patani'nin gücünde ve nüfuzunda bir düşüşe işaret etti.Siyamlarla uzlaşma arayışındaydı, ancak yönetimine siyasi istikrarsızlık ve ticarette düşüş damgasını vurdu.17. yüzyılın ortalarına gelindiğinde Patani kraliçelerinin gücü azalmıştı ve siyasi karışıklık bölgeyi rahatsız ediyordu.Raja Kuning'in 1651'de Kelantan Raja'sı tarafından tahttan indirildiği ve Patani'deki Kelantan hanedanının başlangıcı olduğu iddia edildi.Bölge, özellikle Ayutthaya'dan gelen isyanlar ve istilalarla karşı karşıya kaldı.17. yüzyılın sonuna gelindiğinde siyasi huzursuzluk ve kanunsuzluk, yabancı tüccarların Patani ile ticaret yapmasını engelledi ve Çin kaynaklarında anlatıldığı gibi Patani'nin gerilemesine yol açtı.