Ekber Haşimi Rafsancani'nin 16 Ağustos 1989'da başlayan cumhurbaşkanlığı, İran İslam Cumhuriyeti'ndeki önceki yönetimlerin daha devlet kontrollü yaklaşımının aksine, ekonomik liberalleşmeye odaklanma ve özelleştirmeye doğru bir yönelme ile dikkat çekti."Ekonomik açıdan liberal, siyasi açıdan otoriter ve felsefi açıdan geleneksel" olarak tanımlanan Rafsancani yönetimi, Meclis (İran parlamentosu) içindeki radikal unsurların muhalefetiyle karşı karşıya kaldı.^[114]Görev süresi boyunca Rafsancani, İran-Irak Savaşı'nın ardından İran'ın savaş sonrası yeniden yapılanmasında etkili oldu.Onun ^[yönetimi] aşırı muhafazakarların yetkilerini kısıtlamaya çalıştı, ancak İran Devrim Muhafızları Hamaney'in rehberliğinde daha fazla güç kazandıkça bu çabalar büyük ölçüde başarısız oldu.Rafsancani, hem muhafazakar ^[116] hem de reformcu gruplardan ^[117] yolsuzluk iddialarıyla karşı karşıya kaldı ve onun başkanlığı, muhaliflere yönelik sert baskılarla tanınıyordu.^[118]Savaş sonrası Rafsancani hükümeti ulusal kalkınmaya odaklandı.İran İslam Cumhuriyeti'nin ilk kalkınma planı, İran'ın savunmasını, altyapısını, kültürünü ve ekonomisini modernleştirmeyi amaçlayan onun yönetimi altında hazırlandı.Planda temel ihtiyaçların karşılanması, tüketim kalıplarında reform yapılması ve idari ve adli yönetimin iyileştirilmesi amaçlandı.Rafsancani hükümetinin sanayi ve ulaşım altyapısının geliştirilmesine öncelik vermesi dikkat çekti.Yurt içinde Rafsancani, petrol gelirleriyle desteklenen devlet kasasıyla ekonomik liberalleşmeyi takip ederek serbest piyasa ekonomisini savundu.Dünya Bankası'ndan ilham alan yapısal uyum politikalarını savunarak İran'ı küresel ekonomiye entegre etmeyi hedefledi.Bu yaklaşım, ekonomik yeniden dağıtımı savunan ve Batı müdahalesine karşı katı bir duruş sergileyen halefi Mahmud Ahmedinejad'ın politikalarıyla çelişen, modern, sanayiye dayalı bir ekonomi arayışındaydı.Rafsanjani, hızla değişen küresel manzaraya uyum sağlamanın gerekliliğini vurgulayarak üniversiteler ve endüstriler arasındaki işbirliğini teşvik etti.Eğitim ve kalkınmaya olan bağlılığın sinyalini veren İslami Azad Üniversitesi gibi projeler başlattı.^[119]Rafsancani'nin görev süresi aynı zamanda siyasi muhalifler, Komünistler, Kürtler, Bahailer ve hatta bazı İslam din adamlarının da aralarında bulunduğu çeşitli grupların İran'ın yargı sistemi tarafından infazına tanık oldu.İran Halkın Mücahitleri Örgütü'ne karşı özellikle sert bir tavır aldı ve İslam hukukuna uygun olarak sert cezaları savundu.^[Rafsancani] , Humeyni'nin ölümünün ardından hükümet istikrarını sağlamak için Hamaney ile yakın işbirliği içinde çalıştı.Rafsancani, dış ilişkilerde Arap devletleriyle ilişkileri düzeltmek ve Orta Asya ve Kafkasya'daki ülkelerle bağları genişletmek için çalıştı.Ancak Batılı ülkelerle, özellikle de ABD ile ilişkiler gergin olmaya devam etti.Rafsancani hükümeti, Basra Körfezi Savaşı sırasında insani yardım sağladı ve Orta Doğu'daki barış girişimlerine destek verdi.Aynı zamanda İran'ın nükleer programını desteklemede de önemli bir rol oynadı ve İran'ın nükleer teknoloji kullanımının barışçıl olmasını sağladı.^[121]