Моҳи марти соли 2020, дар пасманзари тазоҳуроти сиёсӣ, Муҳиддин Ёсин дар пайи истеъфои ногаҳонии Маҳатхир Муҳаммад ба мақоми ҳаштумин сарвазири Малайзия таъин шуд.Вай ба хукумати нави коалиционии Перикатан Национал рохбарй мекард.Чанде пас аз ба кор даромадан, пандемияи COVID-19 ба Малайзия зарба зад ва Муҳиддинро водор кард, ки фармоиши назорати ҳаракати Малайзияро (MCO) дар моҳи марти соли 2020 барои ҷилавгирӣ аз паҳншавии он иҷро кунад.Дар ин давра ҳамчунин шоҳиди он буд, ки нахуствазири собиқ Наҷиб Разоқ дар моҳи июли соли 2020 бо иттиҳоми фасод маҳкум шуд, ки бори аввал нахуствазири Малайзия бо чунин маҳкумият рӯбарӯ шуд.Соли 2021 барои маъмурияти Муҳиддин мушкилоти иловагӣ овард.Моҳи январ Янг ди-Пертуан Агонг вазъияти фавқулодда эълон кард, иҷлосияҳои парлумонӣ ва интихоботро мутаваққиф кард ва ба ҳукумат иҷоза дод, ки қонунҳоро бидуни тасдиқи қонунгузорӣ бо сабаби идомаи пандемия ва ноустувории сиёсӣ қабул кунад.Бо вуҷуди ин мушкилот, ҳукумат дар моҳи феврал як барномаи миллии эмкунии COVID-19-ро таҳия кард.Бо вуҷуди ин, дар моҳи март муносибатҳои дипломатӣ байни Малайзия ва Кореяи Шимолӣ пас аз он қатъ карда шуд, ки шикояти як соҳибкори Кореяи Шимолӣ ба ИМА дар бораи истирдоди Додгоҳи олии Куала-Лумпур рад шуд.То августи соли 2021, бӯҳрони сиёсӣ ва саломатӣ шиддат гирифт ва Муҳиддин бо интиқоди густарда барои мубориза бо пандемия ва таназзули иқтисодӣ аз ҷониби ҳукумат рӯбарӯ шуд.Ин боиси он шуд, ки ӯ аз пуштибонии аксарият дар парлумон маҳрум шуд.Дар натиҷа, Муҳиддин 16 августи соли 2021 аз вазифаи сарвазир истеъфо дод. Пас аз истеъфоаш, ӯро Янг ​​ди-Пертуан Агонг то интихоби вориси мувофиқ сарвазири муваққат таъин кард.