Den franska expeditionen till Egypten , skenbart för att stödja den osmanska porten och undertryckamamlukerna , leddes av Napoleon Bonaparte.Bonapartes tillkännagivande i Alexandria betonade jämlikhet, förtjänst och respekt för islam, i kontrast till mamlukernas förmodade brist på dessa egenskaper.Han lovade öppen tillgång till alla egyptier för administrativa poster och föreslog att den påvliga auktoriteten skulle störtas för att visa fransk anslutning till islam.^[102]Egyptierna var dock skeptiska till franska avsikter.Efter den franska segern i slaget vid Embabeh (Pyramidernas slag), där Murad Bey och Ibrahim Beys styrkor besegrades, bildades ett kommunalråd i Kairo inklusive shejker, mamluker och franska medlemmar, som främst tjänade till att genomdriva franska dekret.^[102]Fransk oövervinnlighet ifrågasattes efter deras flottas nederlag i slaget vid Nilen och misslyckande i övre Egypten.Spänningarna eskalerade med införandet av en husskatt, vilket ledde till ett uppror i Kairo i oktober 1798. Den franske generalen Dupuy dödades, men Bonaparte och general Kléber slog snabbt ned upproret.Den franska användningen av Al-Azhar-moskén som stall orsakade djupa anstöt.^[102]Bonapartes syriska expedition 1799 försvagade tillfälligt den franska kontrollen i Egypten.När han återvände besegrade han en gemensam attack av Murad Bey och Ibrahim Bey, och krossade senare en turkisk armé vid Aboukir.Bonaparte lämnade sedan Egypten och utsåg Kléber till sin efterträdare.^[102] Kléber stod inför en prekär situation.Efter att inledande överenskommelser om fransk evakuering blockerades av britterna, upplevde Kairo upplopp, som Kléber slog ned.Han förhandlade med Murad Bey och gav honom kontroll över övre Egypten, men Kléber mördades i juni 1800. ^[102]General Jacques-Francois Menou efterträdde Kléber, som försökte vinna muslimsk gunst men alienerade egyptierna genom att förklara ett franskt protektorat.1801 landade engelska och turkiska styrkor vid Abu Qir, vilket ledde till franska nederlag.General Belliard kapitulerade Kairo i maj, och Menou kapitulerade i Alexandria i augusti, vilket avslutade den franska ockupationen.^[102] Det bestående arvet från den franska ockupationen var "Description de l'Egypte", en detaljerad studie av Egypten av franska forskare, som avsevärt bidrog till egyptologins område.^[102]