Gjenocidi Dzungar ishte shfarosja masive e popullit mongol Dzungar nga dinastia Qing.Perandori Qianlong urdhëroi gjenocidin për shkak të rebelimit në 1755 nga udhëheqësi Dzungar Amursana kundër sundimit Qing, pasi dinastia pushtoi për herë të parë Khanate Dzungar me mbështetjen e Amursana.Gjenocidi u krye nga gjeneralët mançu të ushtrisë Qing të dërguar për të shtypur Dzungarët, të mbështetur nga aleatët dhe vasalët ujgurë për shkak të revoltës ujgure kundër sundimit Dzungar.Khanate Dzungar ishte një konfederatë e disa fiseve tibetiane budiste Oirat mongole që u shfaqën në fillim të shekullit të 17-të dhe perandoria e fundit e madhe nomade në Azi.Disa studiues vlerësojnë se rreth 80% e popullsisë Dzungar, ose rreth 500,000 deri në 800,000 njerëz, u vranë nga një kombinim i luftës dhe sëmundjeve gjatë ose pas pushtimit Qing në 1755-1757.Pasi zhduku popullsinë vendase të Dzungaria, qeveria Qing më pas rivendosi njerëzit Han, Hui, Ujgur dhe Xibe në fermat shtetërore në Dzungaria së bashku me Manchu Bannermen për të ripopulluar zonën.