Depois de Culloden, as forças do governo passaram várias semanas procurando por rebeldes, confiscando gado e queimando casas de reuniões episcopais e católicas não-jurídicas.A brutalidade dessas medidas foi impulsionada por uma percepção generalizada de ambos os lados de que outro desembarque era iminente.Soldados regulares no serviço francês foram tratados como prisioneiros de guerra e posteriormente trocados, independentemente da nacionalidade, mas 3.500 jacobitas capturados foram indiciados por traição.Destes, 120 foram executados, principalmente desertores e membros do Regimento de Manchester.Cerca de 650 morreram aguardando julgamento;900 foram indultados e o restante transportado.