16ਵੀਂ ਸਦੀ ਦੇ ਅਰੰਭ ਵਿੱਚ, 1517 ਵਿੱਚ ਓਟੋਮਨ ਦੀ ਮਿਸਰ ਦੀ ਜਿੱਤ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਸੁਲਤਾਨ ਸੇਲਿਮ ਪਹਿਲੇ ਨੇ ਯੂਨਸ ਪਾਸ਼ਾ ਨੂੰ ਮਿਸਰ ਦਾ ਗਵਰਨਰ ਨਿਯੁਕਤ ਕੀਤਾ, ਪਰ ਭ੍ਰਿਸ਼ਟਾਚਾਰ ਦੇ ਮੁੱਦਿਆਂ ਦੇ ਕਾਰਨ ਜਲਦੀ ਹੀ ਉਸਦੀ ਜਗ੍ਹਾ ਹੇਅਰ ਬੇ ਨੇ ਲੈ ਲਈ।^[97] ਇਸ ਸਮੇਂ ਨੇ ਓਟੋਮੈਨ ਦੇ ਨੁਮਾਇੰਦਿਆਂ ਅਤੇਮਾਮਲੁਕਸ ਵਿਚਕਾਰ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀ ਸੰਘਰਸ਼ ਦੀ ਨਿਸ਼ਾਨਦੇਹੀ ਕੀਤੀ, ਜਿਨ੍ਹਾਂ ਨੇ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਪ੍ਰਭਾਵ ਬਰਕਰਾਰ ਰੱਖਿਆ।ਮਿਸਰ ਦੇ 12 ਸੰਜਕਾਂ ਵਿਚ ਮੁੱਖ ਅਹੁਦਿਆਂ 'ਤੇ ਰਹਿੰਦਿਆਂ ਮਮਲੂਕਾਂ ਨੂੰ ਪ੍ਰਸ਼ਾਸਨਿਕ ਢਾਂਚੇ ਵਿਚ ਸ਼ਾਮਲ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।ਸੁਲਤਾਨ ਸੁਲੇਮਾਨ ਮਹਾਨ ਦੇ ਅਧੀਨ, ਪਾਸ਼ਾ ਦੀ ਸਹਾਇਤਾ ਲਈ ਮਹਾਨ ਦੀਵਾਨ ਅਤੇ ਛੋਟੇ ਦੀਵਾਨ ਦੀ ਸਥਾਪਨਾ ਕੀਤੀ ਗਈ ਸੀ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਫੌਜ ਅਤੇ ਧਾਰਮਿਕ ਅਧਿਕਾਰੀਆਂ ਦੀ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧਤਾ ਸੀ।ਸੇਲੀਮ ਨੇ ਮਿਸਰ ਦੀ ਸੁਰੱਖਿਆ ਲਈ ਛੇ ਰੈਜੀਮੈਂਟਾਂ ਦੀ ਸਥਾਪਨਾ ਕੀਤੀ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਸੁਲੇਮਾਨ ਨੇ ਸੱਤਵਾਂ ਜੋੜਿਆ।^[98]ਓਟੋਮੈਨ ਪ੍ਰਸ਼ਾਸਨ ਨੇ ਮਿਸਰ ਦੇ ਗਵਰਨਰ ਨੂੰ ਅਕਸਰ ਬਦਲਿਆ, ਅਕਸਰ ਸਾਲਾਨਾ.ਇੱਕ ਗਵਰਨਰ, ਹੈਨ ਅਹਿਮਦ ਪਾਸ਼ਾ, ਨੇ ਆਜ਼ਾਦੀ ਦੀ ਸਥਾਪਨਾ ਕਰਨ ਦੀ ਕੋਸ਼ਿਸ਼ ਕੀਤੀ ਪਰ ਉਸਨੂੰ ਅਸਫਲ ਕਰ ਦਿੱਤਾ ਗਿਆ ਅਤੇ ਉਸਨੂੰ ਮਾਰ ਦਿੱਤਾ ਗਿਆ।^[98] 1527 ਵਿੱਚ, ਮਿਸਰ ਵਿੱਚ ਇੱਕ ਭੂਮੀ ਸਰਵੇਖਣ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਜ਼ਮੀਨ ਨੂੰ ਚਾਰ ਕਿਸਮਾਂ ਵਿੱਚ ਸ਼੍ਰੇਣੀਬੱਧ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ: ਸੁਲਤਾਨ ਦਾ ਡੋਮੇਨ, ਜਾਗੀਰ, ਫੌਜੀ ਰੱਖ-ਰਖਾਅ ਵਾਲੀ ਜ਼ਮੀਨ, ਅਤੇ ਧਾਰਮਿਕ ਬੁਨਿਆਦ ਜ਼ਮੀਨਾਂ।ਇਹ ਸਰਵੇਖਣ 1605 ਵਿੱਚ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ। ^[98]ਮਿਸਰ ਵਿੱਚ 17ਵੀਂ ਸਦੀ ਵਿੱਚ ਫੌਜੀ ਵਿਦਰੋਹ ਅਤੇ ਸੰਘਰਸ਼ਾਂ ਦੀ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਸੀ, ਅਕਸਰ ਫੌਜਾਂ ਦੁਆਰਾ ਜਬਰੀ ਵਸੂਲੀ ਨੂੰ ਰੋਕਣ ਦੀਆਂ ਕੋਸ਼ਿਸ਼ਾਂ ਕਾਰਨ।1609 ਵਿੱਚ, ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਸੰਘਰਸ਼ ਕਾਰਾ ਮਹਿਮਦ ਪਾਸ਼ਾ ਦੇ ਕਾਹਿਰਾ ਵਿੱਚ ਜੇਤੂ ਪ੍ਰਵੇਸ਼ ਦਾ ਕਾਰਨ ਬਣਿਆ, ਜਿਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਵਿੱਤੀ ਸੁਧਾਰ ਕੀਤੇ ਗਏ।^[98] ਇਸ ਸਮੇਂ ਦੌਰਾਨ, ਸਥਾਨਕ ਮਮਲੂਕ ਬੇਅਸ ਨੇ ਮਿਸਰੀ ਪ੍ਰਸ਼ਾਸਨ ਵਿੱਚ ਦਬਦਬਾ ਹਾਸਲ ਕੀਤਾ, ਅਕਸਰ ਫੌਜੀ ਅਹੁਦਿਆਂ 'ਤੇ ਰਹੇ ਅਤੇ ਓਟੋਮੈਨ ਦੁਆਰਾ ਨਿਯੁਕਤ ਗਵਰਨਰਾਂ ਨੂੰ ਚੁਣੌਤੀ ਦਿੱਤੀ।^[99] ਮਿਸਰ ਦੀ ਫੌਜ, ਮਜ਼ਬੂਤ ​​ਸਥਾਨਕ ਸਬੰਧਾਂ ਦੇ ਨਾਲ, ਗਵਰਨਰਾਂ ਦੀ ਨਿਯੁਕਤੀ ਨੂੰ ਅਕਸਰ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕਰਦੀ ਸੀ ਅਤੇ ਪ੍ਰਸ਼ਾਸਨ ਉੱਤੇ ਕਾਫ਼ੀ ਨਿਯੰਤਰਣ ਰੱਖਦਾ ਸੀ।^[100]ਸਦੀ ਨੇ ਮਿਸਰ ਵਿੱਚ ਦੋ ਪ੍ਰਭਾਵਸ਼ਾਲੀ ਧੜਿਆਂ ਦਾ ਉਭਾਰ ਵੀ ਦੇਖਿਆ: ਫਕਾਰੀ, ਜੋ ਕਿ ਔਟੋਮੈਨ ਘੋੜਸਵਾਰ ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ, ਅਤੇ ਕਾਸਿਮੀ, ਮੂਲ ਮਿਸਰੀ ਫੌਜਾਂ ਨਾਲ ਜੁੜਿਆ ਹੋਇਆ ਹੈ।ਇਹਨਾਂ ਧੜਿਆਂ ਨੇ, ਉਹਨਾਂ ਦੇ ਵੱਖਰੇ ਰੰਗਾਂ ਅਤੇ ਚਿੰਨ੍ਹਾਂ ਦੁਆਰਾ ਦਰਸਾਇਆ ਗਿਆ, ਨੇ ਓਟੋਮੈਨ ਮਿਸਰ ਦੇ ਸ਼ਾਸਨ ਅਤੇ ਰਾਜਨੀਤੀ ਨੂੰ ਬਹੁਤ ਪ੍ਰਭਾਵਿਤ ਕੀਤਾ।^[101]