En periode med styre under det svenske huset Vasa begynte i Samveldet i år 1587. De to første kongene fra dette dynastiet, Sigismund III (f. 1587–1632) og Władysław IV (r. 1632–1648), forsøkte gjentatte ganger å intriger for tiltredelse til Sveriges trone, som var en konstant kilde til distraksjon for Samveldets anliggender.På den tiden gikk den katolske kirken i gang med en ideologisk motoffensiv og motreformasjonen hevdet mange konvertitter fra polske og litauiske protestantiske miljøer.I 1596 splittet Union of Brest de østkristne i Commonwealth for å opprette Uniate Church of the Eastern Rite, men underlagt pavens autoritet.Zebrzydowski-opprøret mot Sigismund III utspant seg i 1606–1608.Samveldet søkte overherredømme i Øst-Europa, og kjempet kriger med Russland mellom 1605 og 1618 i kjølvannet av Russlands trengselstid;serien av konflikter omtales som den polsk-muskovittiske krigen eller dymitriadene.Innsatsen resulterte i utvidelse av de østlige territoriene til det polsk-litauiske samveldet, men målet om å overta den russiske tronen for det polske regjerende dynastiet ble ikke oppnådd.Sverige søkte overherredømme i Baltikum under de polsk-svenske krigene 1617–1629, og det osmanske riket presset fra sør i kampene ved Cecora i 1620 og Khotyn i 1621. Landbrukets ekspansjon og livegenskapspolitikken i polsk Ukraina resulterte i en serie av kosakkopprør .Alliert med det habsburgske monarkiet deltok ikke Samveldet direkte itrettiårskrigen . Władysławs IV regjeringstid var stort sett fredelig, med en russisk invasjon i form av Smolensk-krigen 1632–1634 som ble avvist.Det ortodokse kirkehierarkiet, forbudt i Polen etter Union of Brest, ble reetablert i 1635.