De Hasmonese Burgeroorlog was een belangrijk conflict in de Joodse geschiedenis dat leidde tot het verlies van de Joodse onafhankelijkheid. Het begon als een machtsstrijd tussen twee broers, Hyrcanus en Aristobulus, die streden om de Hasmonese Joodse Kroon. Aristobulus, de jongste en ambitieuzere van de twee, gebruikte zijn connecties om de controle over ommuurde steden over te nemen en huurde huurlingen in om zichzelf tot koning uit te roepen terwijl hun moeder, Alexandra, nog leefde. Deze actie resulteerde in een confrontatie tussen de twee broers en een periode van burgeroorlog.
De betrokkenheid van de Nabateeërs maakte het conflict nog ingewikkelder toen Antipater de Idumeeër Hyrcanus ervan overtuigde steun te zoeken bij Aretas III, de koning van de Nabateeërs. Hyrcanus sloot een deal met Aretas en bood aan twaalf steden terug te geven aan de Nabateeërs in ruil voor militaire hulp. Met de steun van Nabateese troepen confronteerde Hyrcanus Aristobulus, wat leidde tot een belegering van Jeruzalem.
De Romeinse betrokkenheid bepaalde uiteindelijk de uitkomst van het conflict. Zowel Hyrcanus als Aristobulus zochten steun bij Romeinse functionarissen, maar Pompeius, een Romeinse generaal, koos uiteindelijk de kant van Hyrcanus. Hij belegerde Jeruzalem en na een lange en intense strijd slaagden de troepen van Pompeius erin de verdediging van de stad te doorbreken, wat leidde tot de verovering van Jeruzalem.
Deze gebeurtenis betekende het einde van de onafhankelijkheid van de Hasmonese dynastie, toen Pompeius Hyrcanus opnieuw als hogepriester aanstelde, maar hem zijn koninklijke titel ontnam, waardoor de Romeinse invloed op Judea werd gevestigd. Judea bleef autonoom, maar was verplicht hulde te brengen en was afhankelijk van het Romeinse bestuur in Syrië. Het koninkrijk werd uiteengereten; het werd gedwongen de kustvlakte op te geven, waardoor het de toegang tot de Middellandse Zee en delen van Idumea en Samaria werd ontzegd. Verschillende Hellenistische steden kregen autonomie om de Decapolis te vormen, waardoor de staat sterk verkleind werd.