Bij het eerste licht op 20 juni marcheerde het Taira-leger stilletjes naar Byodo-in, verborgen door dichte mist.De Minamoto hoorden plotseling de Taira-strijdkreet en antwoordden met hun eigen kreet.Er volgde een felle strijd, waarbij monniken en samoerai pijlen door de mist op elkaar afvuurden.Soldaten van de bondgenoten van de Taira, de Ashikaga, doorwaadden de rivier en zetten de aanval in.Prins Mochihito probeerde in de chaos naar Nara te ontsnappen, maar de Taira haalde hem in en executeerde hem.De Nara-monniken die naar Byodo-in marcheerden, hoorden dat ze te laat waren om de Minamoto te helpen, en keerden terug.Minamoto Yorimasa pleegde ondertussen de eerste klassieke seppuku in de geschiedenis, schreef een doodsgedicht op zijn oorlogswaaier en sneed vervolgens zijn eigen buik open.De eerste slag om Uji is beroemd en belangrijk omdat het de Genpei-oorlog heeft geopend.