Selepas kematian Jayavarman VII, anaknya Indravarman II (memerintah 1219–1243) naik takhta.Jayavarman VIII adalah salah seorang raja terkemuka empayar Khmer.Seperti bapanya, dia seorang penganut Buddha, dan dia menyiapkan beberapa kuil yang bermula di bawah pemerintahan bapanya.Sebagai seorang pahlawan dia kurang berjaya.Pada tahun 1220, di bawah tekanan yang semakin meningkat daripada Dai Viet yang semakin berkuasa dan sekutunya Champa, Khmer berundur dari banyak wilayah yang sebelum ini ditakluki dari Chams.Indravarman II digantikan oleh Jayavarman VIII (memerintah 1243–1295).Berbeza dengan pendahulunya, Jayavarman VIII adalah pengikut Shaivisme Hindu dan penentang Buddhisme yang agresif, memusnahkan banyak patung Buddha di empayar dan menukar kuil Buddha kepada kuil Hindu.^[49] Kambuja telah diancam secara luaran pada tahun 1283 olehdinasti Yuan yang dipimpin oleh Mongol.^[50] Jayavarman VIII mengelak peperangan dengan jeneral Sogetu, gabenor Guangzhou, China, dengan membayar penghormatan tahunan kepada Mongol, bermula pada tahun 1285. ^[51] Pemerintahan Jayavarman VIII berakhir pada tahun 1295 apabila dia digulingkan oleh menantunya. Srindravarman (memerintah 1295–1309).Raja baru itu adalah seorang pengikut Buddhisme Theravada, sebuah sekolah agama Buddha yang telah tiba di Asia tenggara dari Sri Lanka dan kemudiannya menyebar ke kebanyakan wilayah itu.Pada Ogos 1296, diplomat China Zhou Daguan tiba di Angkor dan merekodkan, "Dalam perang baru-baru ini dengan Siam , negara itu telah musnah sama sekali".^[52]