Биринчи фитна, исламдын алгачкы жарандык согушу Египеттин башкаруусунда олуттуу өзгөрүүлөргө алып келди.Бул мезгилде халифа Али Мухаммад ибн Аби Бакрды Египеттин губернатору кылып дайындаган.Бирок Амр ибн аль-Ас Омейяддарды колдоп, 658-жылы Ибн Аби Бакрды жеңип, 664-жылы өлгөнгө чейин Египетти башкарган. Омейяддардын тушунда Маслама ибн Мухаллад аль-Ансари сыяктуу Умайядды колдогон партизандар Египетти Экинчи Фитнага чейин башкара берген. .Бул кагылышуу учурунда жергиликтүү арабдар арасында популярдуу болбогон, Харижиттер колдогон Зубейрид режими орногон.Омейяд халифасы Марван I 684-жылы Египетке басып кирип, Омейяддардын көзөмөлүн калыбына келтирип, анын уулу Абд ал-Азизди губернатор кылып дайындаган, ал 20 жыл насаатчы катары эффективдүү башкарган.^[82]Омейяддардын тушунда жергиликтүү аскердик элитадан (жунд) тандалып алынган Абд ал-Малик ибн Рифаа аль-Фахми жана Айюб ибн Шархабил сыяктуу губернаторлор коптторго басымды күчөткөн жана исламдаштырууну баштаган саясаттарды ишке ашырышкан.^[83] Бул салыктын жогорулашынан улам бир нече копт козголоңуна алып келди, алардын эң көрүнүктүүсү 725-жылы болгон. Араб тили 706-жылы расмий мамлекеттик тил болуп, Египет арабчасынын пайда болушуна салым кошкон.Омейяддар доору 739 жана 750-жылдары дагы көтөрүлүштөр менен аяктаган.Аббасиддер доорунда Египет жаңы салыктарды жана андан ары копт козголоңдорун баштан кечирди.Халифа аль-Мутасимдин 834-жылы бийликти жана каржылык көзөмөлдү борборлоштуруу жөнүндө чечими олуттуу өзгөрүүлөргө, анын ичинде жергиликтүү араб аскерлерин түрк аскерлери менен алмаштырууга алып келген.9-кылымда мусулман калкы копт христиандарынан ашып өтүп, арабдаштыруу жана исламдашуу процесстери күчөгөн.Аббасиддер жериндеги «Самаррадагы анархия» Египетте алиддердин революциячыл кыймылдарынын күчөшүнө шарт түздү.^[84]Тулуниддер доору 868-жылы Ахмад ибн Тулун губернатор болуп дайындалганда башталып, Египеттин саясий көз карандысыздыгына карай жылыш болгон.Ички бийлик талаштарына карабастан, Ибн Тулун иш жүзүндө көз карандысыз башкарууну орнотуп, олуттуу байлык топтоп, Леванттын аймагына таасирин тийгизген.Бирок анын мураскорлору ички араздашууларга жана тышкы коркунучтарга дуушар болуп, 905-жылы Аббасиддер Египетти кайра басып алышкан ^[85.]Тулуниден кийинки Египетте чыр-чатактар ​​уланып, түрк командири Мухаммад ибн Тугж ал-Ихшид сыяктуу таасирдүү инсандардын өсүшү байкалган.946-жылы анын өлүмү анын уулу Унужурдун тынчтык жолу менен мураскор болушуна жана андан кийин Кафурдун башкаруусуна алып келген.Бирок 969-жылы Фатимиддердин басып алуусу бул мезгилди аяктап, Египет тарыхынын жаңы доорун ачкан.^[86]