1947 წელს პაკისტანი გაჩნდა, როგორც ახალი ერი, ლიაკატ ალი ხანი, როგორც მისი პირველი პრემიერ მინისტრი და მუჰამედ ალი ჯინა, როგორც გენერალური გუბერნატორი და პარლამენტის თავმჯდომარე.ჯინამ, უარყო ლორდ მაუნტბატენის შეთავაზება ინდოეთის და პაკისტანის გენერალური გუბერნატორის თანამდებობაზე, ხელმძღვანელობდა ქვეყანას სიკვდილამდე 1948 წელს. მისი ხელმძღვანელობით პაკისტანმა გადადგა ნაბიჯები ისლამურ სახელმწიფოდ გამხდარიყო, განსაკუთრებით პრემიერ მინისტრის მიერ მიზნების რეზოლუციის შემოღებით. ხანი 1949 წელს, ხაზს უსვამს ალაჰის სუვერენიტეტს.მიზნების რეზოლუციაში ნათქვამია, რომ სუვერენიტეტი მთელ სამყაროზე ეკუთვნის ყოვლისშემძლე ალლაჰს.^[5]პაკისტანის პირველ წლებში ასევე მნიშვნელოვანი იყო მიგრაცია ინდოეთიდან, განსაკუთრებით კარაჩიში, ^[6] პირველ დედაქალაქში.პაკისტანის ფინანსური ინფრასტრუქტურის გასაძლიერებლად მისმა ფინანსთა მდივანმა ვიქტორ ტერნერმა განახორციელა ქვეყნის პირველი მონეტარული პოლიტიკა.ეს მოიცავდა ისეთი ძირითადი ინსტიტუტების შექმნას, როგორიცაა სახელმწიფო ბანკი, სტატისტიკის ფედერალური ბიურო და შემოსავლების ფედერალური საბჭო, რომელიც მიზნად ისახავს ქვეყნის შესაძლებლობების გაძლიერებას ფინანსების, გადასახადების და შემოსავლების შეგროვებაში.^[7] თუმცა, პაკისტანს მნიშვნელოვანი პრობლემები შეექმნა ინდოეთთან.1948 წლის აპრილში ინდოეთმა შეწყვიტა წყალმომარაგება პაკისტანს პენჯაბის ორი არხის სათავე ნაგებობიდან, რამაც გაამწვავა დაძაბულობა ორ ქვეყანას შორის.გარდა ამისა, ინდოეთმა თავდაპირველად დაიკავა პაკისტანის წილი აქტივებისა და სახსრების გაერთიანებული ინდოეთისგან.ეს აქტივები საბოლოოდ გაათავისუფლეს მაჰათმა განდის ზეწოლის ქვეშ.^[8] ტერიტორიული პრობლემები წარმოიშვა მეზობელ ავღანეთთან პაკისტან-ავღანეთის საზღვარზე 1949 წელს და ინდოეთთან ქაშმირში კონტროლის ხაზთან დაკავშირებით.^[9]ქვეყანა ასევე ცდილობდა საერთაშორისო აღიარებას, ირანი იყო პირველი, ვინც აღიარა იგი, მაგრამ საბჭოთა კავშირისა და ისრაელის თავდაპირველი უხალისობის წინაშე აღმოჩნდა.პაკისტანი აქტიურად ახორციელებდა ლიდერობას მუსულმანურ სამყაროში, მიზნად ისახავდა მუსულმანური ქვეყნების გაერთიანებას.თუმცა, ეს ამბიცია სკეპტიციზმის წინაშე აღმოჩნდა საერთაშორისო დონეზე და ზოგიერთ არაბულ ერში.პაკისტანი ასევე მხარს უჭერდა სხვადასხვა დამოუკიდებლობის მოძრაობას მუსლიმურ სამყაროში.საშინაო თვალსაზრისით, ენობრივი პოლიტიკა სადავო საკითხი გახდა, ჯინამ გამოაცხადა ურდუ სახელმწიფო ენად, რამაც გამოიწვია დაძაბულობა აღმოსავლეთ ბენგალში.1948 წელს ჯინას გარდაცვალების შემდეგ, სერ ხავაჯა ნაზიმუდინი გახდა გენერალური გუბერნატორი, რომელიც აგრძელებდა ერის მშენებლობას პაკისტანის ჩამოყალიბების წლებში.