1258-დან 1291 წლამდე რეგიონი განიცდიდა არეულობას, როგორც საზღვარი მონღოლ დამპყრობლებს შორის, რომლებიც ხანდახან მოკავშირეობდნენ ჯვაროსნებსა დაეგვიპტისმამლუქებს შორის.ამ კონფლიქტმა გამოიწვია მოსახლეობის მნიშვნელოვანი შემცირება და ეკონომიკური გაჭირვება.მამლუქები ძირითადად თურქული წარმოშობის იყვნენ და ბავშვობაში ყიდულობდნენ და შემდეგ ამზადებდნენ ომში.ისინი იყვნენ უაღრესად დაფასებული მეომრები, რომლებმაც მმართველებს ადგილობრივი არისტოკრატიის დამოუკიდებლობა მისცეს.ეგვიპტეში მათ ხელში ჩაიგდეს სამეფო ჯვაროსნების წარუმატებელი შემოსევის შემდეგ (მეშვიდე ჯვაროსნული ლაშქრობა).მამლუქებმა აიღეს კონტროლი ეგვიპტეში და გააფართოვეს თავიანთი მმართველობა პალესტინამდე.პირველმა მამლუქის სულთანმა, კუტუზმა, დაამარცხა მონღოლები აინ ჯალუტის ბრძოლაში, მაგრამ მოკლა ბაიბარსმა, რომელიც მის ნაცვლად გადავიდა და გაანადგურა ჯვაროსნების ფორპოსტების უმეტესობა.მამლუქები მართავდნენ პალესტინას 1516 წლამდე და მას სირიის ნაწილად თვლიდნენ.ჰებრონში ებრაელებს შეექმნათ შეზღუდვები პატრიარქების გამოქვაბულში, იუდაიზმის მნიშვნელოვანი ადგილი, შეზღუდვა, რომელიც გაგრძელდა ექვსდღიან ომამდე.^[146]ალ-აშრაფ ხალილმა, მამლუქთა სულთანმა, დაიპყრო ჯვაროსანთა ბოლო დასაყრდენი 1291 წელს. მამლუქებმა, აგრძელებდნენ აიუბიდების პოლიტიკას, სტრატეგიულად გაანადგურეს სანაპირო რეგიონები ტიროსიდან ღაზამდე, რათა თავიდან აიცილონ ჯვაროსნული საზღვაო თავდასხმები.ამ განადგურებამ გამოიწვია ამ ტერიტორიების გრძელვადიანი დეპოპულაცია და ეკონომიკური ვარდნა.^[147]ებრაულმა საზოგადოებამ პალესტინაში გაახალგაზრდავება დაინახა სეფარდი ებრაელების შემოდინებით 1492 წელსესპანეთიდან მათი განდევნის და 1497 წელს პორტუგალიაში დევნის შემდეგ. მამლუქების და მოგვიანებით ოსმალეთის მმართველობის დროს ეს სეფარდი ებრაელები ძირითადად დასახლდნენ ქალაქებში, როგორიცაა საფედი და იერუსალიმი, განსხვავებით იერუსალიმისგან. ძირითადად სოფლის მუსტაარბი ებრაული თემი.^[148]