A partire dal 1480, Ava dovette affrontare continue ribellioni interne e attacchi esterni da parte degli Stati Shan, e iniziò a disintegrarsi.Nel 1510, anche Taungoo, situata nel remoto angolo sud-orientale del regno di Ava, dichiarò l'indipendenza.^[39] Quando la Confederazione degli Stati Shan conquistò Ava nel 1527, molti rifugiati fuggirono a sud-est verso Taungoo, un piccolo regno in pace senza sbocco sul mare e circondato da regni più grandi ostili.Taungoo, guidato dal suo ambizioso re Tabinshwehti e dal suo vice generale Bayinnaung, avrebbe continuato a riunificare i piccoli regni che esistevano dalla caduta dell'Impero Pagano e avrebbe fondato il più grande impero nella storia del sud-est asiatico.In primo luogo, il nuovo regno sconfisse un Hanthawaddy più potente nella guerra Taungoo-Hanthawaddy (1534–41).Tabinshwehti trasferì la capitale a Bago appena conquistata nel 1539. Taungoo aveva ampliato la sua autorità fino a Pagan nel 1544 ma non riuscì a conquistare Arakan nel 1545–47 e il Siam nel 1547–49.Il successore di Tabinshwehti, Bayinnaung, continuò la politica di espansione, conquistando Ava nel 1555, gli stati Nearer/Cis-Salween Shan (1557), Lan Na (1558), Manipur (1560), Farther/Trans-Salween Shan (1562–63), gli stati Siam (1564, 1569) e Lan Xang (1565–74), portando sotto il suo dominio gran parte del continente occidentale e centrale del sud-est asiatico.Bayinnaung mise in atto un sistema amministrativo duraturo che ridusse il potere dei capi Shan ereditari e allineò le usanze Shan alle norme delle terre pianeggianti.^[40] Ma non poteva replicare un sistema amministrativo efficace ovunque nel suo vasto impero.Il suo impero era una raccolta di ex regni sovrani, i cui re gli erano fedeli, non il regno di Taungoo.L'impero troppo esteso, tenuto insieme da rapporti mecenati-clienti, declinò subito dopo la sua morte nel 1581. Il Siam si separò nel 1584 ed entrò in guerra con la Birmania fino al 1605. Nel 1597, il regno aveva perso tutti i suoi possedimenti, compreso Taungoo, la casa ancestrale della dinastia.Nel 1599, le forze Arakanesi aiutate dai mercenari portoghesi e in alleanza con le forze ribelli Taungoo, saccheggiarono Pegu.Il paese cadde nel caos e ogni regione reclamava un re.Il mercenario portoghese Filipe de Brito e Nicote si ribellò prontamente ai suoi padroni arakanesi e stabilì il dominio portoghese sostenuto da Goa a Thanlyin nel 1603.Nonostante sia stato un periodo tumultuoso per il Myanmar, le espansioni di Taungoo hanno aumentato la portata internazionale della nazione.I nuovi ricchi mercanti del Myanmar commerciavano fino al Rajahnate di Cebu nelle Filippine dove vendevano zucchero birmano (śarkarā) in cambio di oro cebuano.^[41] I filippini avevano anche comunità di mercanti in Myanmar, lo storico William Henry Scott, citando il manoscritto portoghese Summa Orientalis, notò che Mottama in Birmania (Myanmar) aveva una grande presenza di mercanti da Mindanao, nelle Filippine.^[42] I Lucoe, rivali dell'altro gruppo filippino, i Mindanaoani, che provenivano invece dall'isola di Luzon, furono assoldati come mercenari e soldati sia per il Siam (Thailandia) che per la Birmania (Myanmar), nella regione birmano-siamese Guerre, lo stesso caso dei portoghesi, anch'essi mercenari per entrambe le parti.^[43]