Pada tahun 1406, ^[36] pasukan Burma dari Kerajaan Ava menyerbu Arakan.Penguasaan Arakan adalah bagian dari Perang Empat Puluh Tahun antara Ava dan Hanthawaddy Pegu di daratan Burma.Penguasaan Arakan berpindah tangan beberapa kali sebelum pasukan Hanthawaddy mengusir pasukan Ava pada tahun 1412. Ava akan mempertahankan kekuasaan di Arakan utara hingga tahun 1416/17 tetapi tidak mencoba merebut kembali Arakan.Pengaruh Hanthawaddy berakhir setelah kematian Raja Razadarit pada tahun 1421. Mantan penguasa Arakan Min Saw Mon menerima suaka di Kesultanan Benggala dan tinggal di sana di Pandua selama 24 tahun.Saw Mon menjadi dekat dengan Sultan Benggala Jalaluddin Muhammad Shah, menjabat sebagai komandan pasukan raja.Saw Mon meyakinkan sultan untuk membantu mengembalikan tahtanya yang hilang.^[37]Saw Mon mendapatkan kembali kendali atas takhta Arakan pada tahun 1430 dengan bantuan militer dari komandan Bengali Wali Khan dan Sindhi Khan.Ia kemudian mendirikan ibu kota kerajaan baru, Mrauk U. Kerajaannya kemudian dikenal sebagai Kerajaan Mrauk U.Arakan menjadi negara bawahan Kesultanan Benggala dan mengakui kedaulatan Bengali atas beberapa wilayah di Arakan utara.Sebagai pengakuan atas status bawahan kerajaannya, raja-raja Arakan menerima gelar Islam, meskipun beragama Buddha, dan melegalkan penggunaan koin dinar emas Islam dari Benggala di dalam kerajaan tersebut.Para raja membandingkan diri mereka dengan para sultan dan mempekerjakan umat Islam pada posisi bergengsi dalam pemerintahan kerajaan.Saw Mon, sekarang bergelar Suleiman Shah, meninggal pada tahun 1433, dan digantikan oleh adiknya Min Khayi.Meskipun awalnya merupakan protektorat Kesultanan Benggala dari tahun 1429 hingga 1531, Mrauk-U kemudian menaklukkan Chittagong dengan bantuan Portugis.Ia dua kali menangkis upaya Toungoo Burma untuk menaklukkan kerajaan tersebut pada tahun 1546–1547, dan 1580–1581.Pada puncak kekuasaannya, ia sempat menguasai garis pantai Teluk Benggala dari Sundarbans hingga Teluk Martaban dari tahun 1599 hingga 1603. ^[38] Pada tahun 1666, ia kehilangan kendali atas Chittagong setelah perang dengan Kekaisaran Mughal .Pemerintahannya berlanjut hingga tahun 1785, ketika ditaklukkan oleh dinasti Konbaung di Burma.Kota ini merupakan rumah bagi populasi multietnis dan kota Mrauk U menjadi rumah bagi masjid, kuil, tempat suci, seminari, dan perpustakaan.Kerajaan ini juga merupakan pusat pembajakan dan perdagangan budak.Tempat ini sering dikunjungi oleh pedagang Arab, Denmark, Belanda dan Portugis .