Tijekom okupacije podignute su etničke napetosti i jača nacionalizam.^[82] Britanija je bankrotirala i nova laburistička vlada željela je povući svoje snage s Istoka.Ali većina Malajaca bila je više zabrinuta za obranu od MCP-a nego za traženje neovisnosti od Britanaca.Godine 1944. Britanci su izradili planove za malajsku uniju, koja bi federalne i nefederativne malajske države, plus Penang i Malaccu (ali ne i Singapur ), pretvorila u jedinstvenu krunsku koloniju, s pogledom prema neovisnosti.Ovaj potez, usmjeren ka konačnoj neovisnosti, naišao je na značajan otpor Malajaca, prvenstveno zbog predloženog jednakog državljanstva za etničke Kineze i druge manjine.Britanci su te skupine smatrali lojalnijima tijekom rata od Malajaca.Ovo je protivljenje dovelo do raspada Malajske unije 1948., ustupivši mjesto Federaciji Malaje, koja je zadržala autonomiju malajskih državnih vladara pod britanskom zaštitom.Paralelno s tim političkim promjenama, Komunistička partija Malaje (MCP), prvenstveno podržana od etničkih Kineza, dobivala je zamah.MCP, u početku legalna stranka, okrenula se gerilskom ratovanju s težnjama protjerivanja Britanaca iz Malaje.U srpnju 1948. britanska vlada proglasila je izvanredno stanje, što je natjeralo MCP da se povuče u džunglu i formira Malajsku narodnooslobodilačku vojsku.Temeljni uzroci ovog sukoba kretali su se od ustavnih promjena koje su marginalizirale etničke Kineze do raseljavanja seljaka radi razvoja plantaža.Međutim, MCP je dobio minimalnu podršku globalnih komunističkih sila.Malajsko izvanredno stanje, koje je trajalo od 1948. do 1960., pokazalo je da su Britanci protiv MCP-a primijenili modernu protupobunjeničku taktiku, koju je osmislio general-pukovnik Sir Gerald Templer.Dok je sukob vidio svoj udio u zločinima, kao što je masakr u Batang Kaliju, britanska strategija izolacije MCP-a od baze podrške, zajedno s ekonomskim i političkim ustupcima, postupno je oslabila pobunjenike.Do sredine 1950-ih, plima se okrenula protiv MCP-a, postavljajući pozornicu za nezavisnost Federacije unutar Commonwealtha 31. kolovoza 1957., s Tunku Abdul Rahmanom kao inauguracijskim premijerom.